Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG9BQ674R7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG9BQ674R7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG9BQ674R7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG9BQ674R7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG9BQ674R7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG9BQ674R7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG9BQ674R7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG9BQ674R7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG9BQ674R7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG9BQ674R7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG9BQ674R7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG9BQ674R7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG9BQ674R7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG9BQ674R7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG9BQ674R7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG9BQ674R7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG9BQ674R7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG9BQ674R7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG9BQ674R7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG9BQ674R7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG9BQ674R7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG9BQ674R7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG9BQ674R7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG9BQ674R7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG9BQ674R7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG9BQ674R7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG9BQ674R7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG9BQ674R7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG9BQ674R7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG9BQ674R7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG9BQ674R7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG9BQ674R7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG9BQ674R7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG9BQ674R7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG9BQ674R7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG9BQ674R7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG9BQ674R7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG9BQ674R7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATG9BQ674R7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATG9BQ674R7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATG9BQ674R7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG9BQ674R7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG9BQ674R7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG9BQ674R7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG9BQ674R7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG9BQ674R7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG9BQ674R7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG9BQ674R7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG9BQ674R7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG9BQ674R7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG9BQ674R7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG9BQ674R7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG9BQ674R7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG9BQ674R7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG9BQ674R7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG9BQ674R7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9BQ674R7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9BQ674R7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9BQ674R7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9BQ674R7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG9BQ674R7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG9BQ674R7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG9BQ674R7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG9BQ674R7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG9BQ674R7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG9BQ674R7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG9BQ674R7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ATG9BQ674R7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG9BQ674R7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG9BQ674R7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG9BQ674R7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG9BQ674R7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG9BQ674R7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG9BQ674R7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG9BQ674R7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG9BQ674R7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG9BQ674R7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG9BQ674R7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG9BQ674R7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG9BQ674R7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG9BQ674R7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG9BQ674R7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG9BQ674R7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG9BQ674R7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG9BQ674R7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG9BQ674R7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG9BQ674R7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG9BQ674R7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG9BQ674R7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG9BQ674R7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG9BQ674R7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG9BQ674R7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG9BQ674R7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG9BQ674R7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG9BQ674R7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG9BQ674R7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG9BQ674R7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG9BQ674R7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG9BQ674R7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms