Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CEP135Q66GS9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CEP135Q66GS9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CEP135Q66GS9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CEP135Q66GS9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CEP135Q66GS9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CEP135Q66GS9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CEP135Q66GS9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CEP135Q66GS9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CEP135Q66GS9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CEP135Q66GS9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CEP135Q66GS9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CEP135Q66GS9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CEP135Q66GS9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CEP135Q66GS9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CEP135Q66GS9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CEP135Q66GS9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CEP135Q66GS9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CEP135Q66GS9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CEP135Q66GS9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CEP135Q66GS9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CEP135Q66GS9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CEP135Q66GS9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CEP135Q66GS9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CEP135Q66GS9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CEP135Q66GS9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CEP135Q66GS9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CEP135Q66GS9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CEP135Q66GS9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CEP135Q66GS9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CEP135Q66GS9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CEP135Q66GS9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CEP135Q66GS9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CEP135Q66GS9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CEP135Q66GS9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP135Q66GS9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP135Q66GS9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP135Q66GS9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP135Q66GS9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP135Q66GS9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP135Q66GS9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP135Q66GS9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP135Q66GS9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP135Q66GS9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP135Q66GS9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP135Q66GS9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP135Q66GS9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP135Q66GS9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CEP135Q66GS9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CEP135Q66GS9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CEP135Q66GS9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CEP135Q66GS9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CEP135Q66GS9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP135Q66GS9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP135Q66GS9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP135Q66GS9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP135Q66GS9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP135Q66GS9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP135Q66GS9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP135Q66GS9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP135Q66GS9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP135Q66GS9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP135Q66GS9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP135Q66GS9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP135Q66GS9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP135Q66GS9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP135Q66GS9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP135Q66GS9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CEP135Q66GS9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CEP135Q66GS9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP135Q66GS9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP135Q66GS9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP135Q66GS9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP135Q66GS9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP135Q66GS9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP135Q66GS9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP135Q66GS9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CEP135Q66GS9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CEP135Q66GS9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CEP135Q66GS9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP135Q66GS9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CEP135Q66GS9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CEP135Q66GS9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CEP135Q66GS9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP135Q66GS9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP135Q66GS9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP135Q66GS9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP135Q66GS9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP135Q66GS9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP135Q66GS9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP135Q66GS9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CEP135Q66GS9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP135Q66GS9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP135Q66GS9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CEP135Q66GS9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CEP135Q66GS9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP135Q66GS9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP135Q66GS9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CEP135Q66GS9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CEP135Q66GS9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms