Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNYL2Q5T2Q4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNYL2Q5T2Q4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNYL2Q5T2Q4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNYL2Q5T2Q4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNYL2Q5T2Q4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNYL2Q5T2Q4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNYL2Q5T2Q4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNYL2Q5T2Q4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNYL2Q5T2Q4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNYL2Q5T2Q4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNYL2Q5T2Q4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNYL2Q5T2Q4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNYL2Q5T2Q4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNYL2Q5T2Q4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNYL2Q5T2Q4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNYL2Q5T2Q4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNYL2Q5T2Q4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNYL2Q5T2Q4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNYL2Q5T2Q4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNYL2Q5T2Q4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNYL2Q5T2Q4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNYL2Q5T2Q4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNYL2Q5T2Q4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNYL2Q5T2Q4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNYL2Q5T2Q4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNYL2Q5T2Q4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNYL2Q5T2Q4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNYL2Q5T2Q4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNYL2Q5T2Q4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNYL2Q5T2Q4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNYL2Q5T2Q4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNYL2Q5T2Q4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNYL2Q5T2Q4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNYL2Q5T2Q4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNYL2Q5T2Q4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNYL2Q5T2Q4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCNYL2Q5T2Q4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNYL2Q5T2Q4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNYL2Q5T2Q4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNYL2Q5T2Q4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNYL2Q5T2Q4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNYL2Q5T2Q4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNYL2Q5T2Q4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNYL2Q5T2Q4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNYL2Q5T2Q4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNYL2Q5T2Q4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNYL2Q5T2Q4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNYL2Q5T2Q4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNYL2Q5T2Q4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNYL2Q5T2Q4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNYL2Q5T2Q4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNYL2Q5T2Q4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNYL2Q5T2Q4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNYL2Q5T2Q4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNYL2Q5T2Q4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNYL2Q5T2Q4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCNYL2Q5T2Q4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCNYL2Q5T2Q4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNYL2Q5T2Q4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNYL2Q5T2Q4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNYL2Q5T2Q4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNYL2Q5T2Q4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNYL2Q5T2Q4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNYL2Q5T2Q4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNYL2Q5T2Q4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNYL2Q5T2Q4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNYL2Q5T2Q4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNYL2Q5T2Q4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNYL2Q5T2Q4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNYL2Q5T2Q4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNYL2Q5T2Q4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNYL2Q5T2Q4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNYL2Q5T2Q4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNYL2Q5T2Q4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCNYL2Q5T2Q4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNYL2Q5T2Q4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNYL2Q5T2Q4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNYL2Q5T2Q4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNYL2Q5T2Q4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNYL2Q5T2Q4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms