Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NOM1Q5C9Z4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NOM1Q5C9Z4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NOM1Q5C9Z4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NOM1Q5C9Z4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NOM1Q5C9Z4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NOM1Q5C9Z4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NOM1Q5C9Z4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NOM1Q5C9Z4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NOM1Q5C9Z4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NOM1Q5C9Z4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NOM1Q5C9Z4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NOM1Q5C9Z4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NOM1Q5C9Z4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NOM1Q5C9Z4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NOM1Q5C9Z4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NOM1Q5C9Z4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NOM1Q5C9Z4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NOM1Q5C9Z4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NOM1Q5C9Z4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NOM1Q5C9Z4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NOM1Q5C9Z4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NOM1Q5C9Z4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NOM1Q5C9Z4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NOM1Q5C9Z4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
NOM1Q5C9Z4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NOM1Q5C9Z4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NOM1Q5C9Z4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NOM1Q5C9Z4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NOM1Q5C9Z4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NOM1Q5C9Z4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NOM1Q5C9Z4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NOM1Q5C9Z4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NOM1Q5C9Z4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NOM1Q5C9Z4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NOM1Q5C9Z4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NOM1Q5C9Z4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NOM1Q5C9Z4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NOM1Q5C9Z4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NOM1Q5C9Z4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NOM1Q5C9Z4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NOM1Q5C9Z4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NOM1Q5C9Z4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NOM1Q5C9Z4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NOM1Q5C9Z4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NOM1Q5C9Z4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NOM1Q5C9Z4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NOM1Q5C9Z4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NOM1Q5C9Z4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NOM1Q5C9Z4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NOM1Q5C9Z4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NOM1Q5C9Z4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NOM1Q5C9Z4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NOM1Q5C9Z4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NOM1Q5C9Z4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NOM1Q5C9Z4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NOM1Q5C9Z4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NOM1Q5C9Z4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NOM1Q5C9Z4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NOM1Q5C9Z4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NOM1Q5C9Z4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NOM1Q5C9Z4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NOM1Q5C9Z4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NOM1Q5C9Z4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NOM1Q5C9Z4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NOM1Q5C9Z4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NOM1Q5C9Z4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
NOM1Q5C9Z4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NOM1Q5C9Z4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
NOM1Q5C9Z4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NOM1Q5C9Z4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NOM1Q5C9Z4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NOM1Q5C9Z4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NOM1Q5C9Z4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
NOM1Q5C9Z4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NOM1Q5C9Z4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NOM1Q5C9Z4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NOM1Q5C9Z4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NOM1Q5C9Z4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NOM1Q5C9Z4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NOM1Q5C9Z4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NOM1Q5C9Z4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NOM1Q5C9Z4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NOM1Q5C9Z4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NOM1Q5C9Z4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NOM1Q5C9Z4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NOM1Q5C9Z4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NOM1Q5C9Z4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NOM1Q5C9Z4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NOM1Q5C9Z4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NOM1Q5C9Z4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NOM1Q5C9Z4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NOM1Q5C9Z4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NOM1Q5C9Z4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NOM1Q5C9Z4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NOM1Q5C9Z4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NOM1Q5C9Z4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NOM1Q5C9Z4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NOM1Q5C9Z4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NOM1Q5C9Z4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms