Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0A6

MINDY4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4Q4G0A6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MINDY4Q4G0A6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MINDY4Q4G0A6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MINDY4Q4G0A6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MINDY4Q4G0A6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MINDY4Q4G0A6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MINDY4Q4G0A6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MINDY4Q4G0A6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MINDY4Q4G0A6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MINDY4Q4G0A6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MINDY4Q4G0A6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MINDY4Q4G0A6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MINDY4Q4G0A6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MINDY4Q4G0A6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MINDY4Q4G0A6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MINDY4Q4G0A6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MINDY4Q4G0A6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MINDY4Q4G0A6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MINDY4Q4G0A6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MINDY4Q4G0A6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MINDY4Q4G0A6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MINDY4Q4G0A6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MINDY4Q4G0A6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MINDY4Q4G0A6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MINDY4Q4G0A6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MINDY4Q4G0A6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MINDY4Q4G0A6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MINDY4Q4G0A6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MINDY4Q4G0A6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MINDY4Q4G0A6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MINDY4Q4G0A6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MINDY4Q4G0A6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MINDY4Q4G0A6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MINDY4Q4G0A6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MINDY4Q4G0A6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MINDY4Q4G0A6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MINDY4Q4G0A6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MINDY4Q4G0A6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MINDY4Q4G0A6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MINDY4Q4G0A6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MINDY4Q4G0A6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MINDY4Q4G0A6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MINDY4Q4G0A6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MINDY4Q4G0A6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MINDY4Q4G0A6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MINDY4Q4G0A6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MINDY4Q4G0A6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MINDY4Q4G0A6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MINDY4Q4G0A6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MINDY4Q4G0A6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MINDY4Q4G0A6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MINDY4Q4G0A6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MINDY4Q4G0A6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MINDY4Q4G0A6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MINDY4Q4G0A6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MINDY4Q4G0A6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MINDY4Q4G0A6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MINDY4Q4G0A6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MINDY4Q4G0A6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MINDY4Q4G0A6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MINDY4Q4G0A6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MINDY4Q4G0A6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MINDY4Q4G0A6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MINDY4Q4G0A6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MINDY4Q4G0A6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MINDY4Q4G0A6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MINDY4Q4G0A6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MINDY4Q4G0A6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MINDY4Q4G0A6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MINDY4Q4G0A6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MINDY4Q4G0A6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MINDY4Q4G0A6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MINDY4Q4G0A6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MINDY4Q4G0A6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MINDY4Q4G0A6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MINDY4Q4G0A6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MINDY4Q4G0A6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MINDY4Q4G0A6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MINDY4Q4G0A6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MINDY4Q4G0A6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MINDY4Q4G0A6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MINDY4Q4G0A6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MINDY4Q4G0A6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MINDY4Q4G0A6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MINDY4Q4G0A6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MINDY4Q4G0A6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MINDY4Q4G0A6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MINDY4Q4G0A6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MINDY4Q4G0A6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MINDY4Q4G0A6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MINDY4Q4G0A6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MINDY4Q4G0A6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MINDY4Q4G0A6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MINDY4Q4G0A6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MINDY4Q4G0A6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MINDY4Q4G0A6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MINDY4Q4G0A6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MINDY4Q4G0A6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MINDY4Q4G0A6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MINDY4Q4G0A6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms