Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
NBPF8Q3BBV2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NBPF8Q3BBV2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
NBPF8Q3BBV2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
NBPF8Q3BBV2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
NBPF8Q3BBV2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
NBPF8Q3BBV2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
NBPF8Q3BBV2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
NBPF8Q3BBV2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NBPF8Q3BBV2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
NBPF8Q3BBV2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NBPF8Q3BBV2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
NBPF8Q3BBV2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
NBPF8Q3BBV2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
NBPF8Q3BBV2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
NBPF8Q3BBV2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NBPF8Q3BBV2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
NBPF8Q3BBV2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NBPF8Q3BBV2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NBPF8Q3BBV2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
NBPF8Q3BBV2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
NBPF8Q3BBV2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NBPF8Q3BBV2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
NBPF8Q3BBV2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
NBPF8Q3BBV2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
NBPF8Q3BBV2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NBPF8Q3BBV2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
NBPF8Q3BBV2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
NBPF8Q3BBV2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
NBPF8Q3BBV2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NBPF8Q3BBV2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NBPF8Q3BBV2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NBPF8Q3BBV2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NBPF8Q3BBV2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
NBPF8Q3BBV2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
NBPF8Q3BBV2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NBPF8Q3BBV2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
NBPF8Q3BBV2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NBPF8Q3BBV2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
NBPF8Q3BBV2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NBPF8Q3BBV2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NBPF8Q3BBV2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
NBPF8Q3BBV2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NBPF8Q3BBV2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
NBPF8Q3BBV2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
NBPF8Q3BBV2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NBPF8Q3BBV2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NBPF8Q3BBV2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NBPF8Q3BBV2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
NBPF8Q3BBV2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
NBPF8Q3BBV2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.57■■■■□ 3.76
NBPF8Q3BBV2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
NBPF8Q3BBV2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NBPF8Q3BBV2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NBPF8Q3BBV2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
NBPF8Q3BBV2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
NBPF8Q3BBV2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NBPF8Q3BBV2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
NBPF8Q3BBV2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
NBPF8Q3BBV2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
NBPF8Q3BBV2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
NBPF8Q3BBV2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NBPF8Q3BBV2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NBPF8Q3BBV2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NBPF8Q3BBV2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NBPF8Q3BBV2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
NBPF8Q3BBV2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
NBPF8Q3BBV2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NBPF8Q3BBV2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NBPF8Q3BBV2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NBPF8Q3BBV2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NBPF8Q3BBV2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
NBPF8Q3BBV2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NBPF8Q3BBV2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NBPF8Q3BBV2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NBPF8Q3BBV2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
NBPF8Q3BBV2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
NBPF8Q3BBV2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
NBPF8Q3BBV2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
NBPF8Q3BBV2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
NBPF8Q3BBV2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
NBPF8Q3BBV2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
NBPF8Q3BBV2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
NBPF8Q3BBV2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
NBPF8Q3BBV2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NBPF8Q3BBV2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NBPF8Q3BBV2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NBPF8Q3BBV2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NBPF8Q3BBV2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NBPF8Q3BBV2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NBPF8Q3BBV2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NBPF8Q3BBV2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NBPF8Q3BBV2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NBPF8Q3BBV2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NBPF8Q3BBV2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NBPF8Q3BBV2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NBPF8Q3BBV2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NBPF8Q3BBV2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NBPF8Q3BBV2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NBPF8Q3BBV2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.9 ms