Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HFEQ30201 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HFEQ30201 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HFEQ30201 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HFEQ30201 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HFEQ30201 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HFEQ30201 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HFEQ30201 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HFEQ30201 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HFEQ30201 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HFEQ30201 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HFEQ30201 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HFEQ30201 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HFEQ30201 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HFEQ30201 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HFEQ30201 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HFEQ30201 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HFEQ30201 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HFEQ30201 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HFEQ30201 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HFEQ30201 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HFEQ30201 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HFEQ30201 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HFEQ30201 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HFEQ30201 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HFEQ30201 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HFEQ30201 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HFEQ30201 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HFEQ30201 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HFEQ30201 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HFEQ30201 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HFEQ30201 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HFEQ30201 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HFEQ30201 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HFEQ30201 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HFEQ30201 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HFEQ30201 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HFEQ30201 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HFEQ30201 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HFEQ30201 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HFEQ30201 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HFEQ30201 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HFEQ30201 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HFEQ30201 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HFEQ30201 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HFEQ30201 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HFEQ30201 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HFEQ30201 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HFEQ30201 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HFEQ30201 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HFEQ30201 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HFEQ30201 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HFEQ30201 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HFEQ30201 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HFEQ30201 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HFEQ30201 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HFEQ30201 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HFEQ30201 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HFEQ30201 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HFEQ30201 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HFEQ30201 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HFEQ30201 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HFEQ30201 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HFEQ30201 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HFEQ30201 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HFEQ30201 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HFEQ30201 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HFEQ30201 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HFEQ30201 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HFEQ30201 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HFEQ30201 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HFEQ30201 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HFEQ30201 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HFEQ30201 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HFEQ30201 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HFEQ30201 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HFEQ30201 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HFEQ30201 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HFEQ30201 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HFEQ30201 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HFEQ30201 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HFEQ30201 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HFEQ30201 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HFEQ30201 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HFEQ30201 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HFEQ30201 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HFEQ30201 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HFEQ30201 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HFEQ30201 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HFEQ30201 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HFEQ30201 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HFEQ30201 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HFEQ30201 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HFEQ30201 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HFEQ30201 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HFEQ30201 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HFEQ30201 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HFEQ30201 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HFEQ30201 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HFEQ30201 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms