Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTU2Q2VPK5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTU2Q2VPK5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
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