Protein–RNA interactions for Protein: Q2TB90

HKDC1, Putative hexokinase HKDC1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKDC1Q2TB90 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HKDC1Q2TB90 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HKDC1Q2TB90 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HKDC1Q2TB90 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HKDC1Q2TB90 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HKDC1Q2TB90 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HKDC1Q2TB90 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HKDC1Q2TB90 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HKDC1Q2TB90 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HKDC1Q2TB90 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HKDC1Q2TB90 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HKDC1Q2TB90 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HKDC1Q2TB90 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HKDC1Q2TB90 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HKDC1Q2TB90 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HKDC1Q2TB90 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HKDC1Q2TB90 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HKDC1Q2TB90 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HKDC1Q2TB90 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HKDC1Q2TB90 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HKDC1Q2TB90 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HKDC1Q2TB90 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HKDC1Q2TB90 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HKDC1Q2TB90 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HKDC1Q2TB90 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HKDC1Q2TB90 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HKDC1Q2TB90 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HKDC1Q2TB90 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HKDC1Q2TB90 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HKDC1Q2TB90 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
HKDC1Q2TB90 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HKDC1Q2TB90 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HKDC1Q2TB90 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HKDC1Q2TB90 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HKDC1Q2TB90 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HKDC1Q2TB90 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HKDC1Q2TB90 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HKDC1Q2TB90 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HKDC1Q2TB90 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HKDC1Q2TB90 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HKDC1Q2TB90 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HKDC1Q2TB90 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HKDC1Q2TB90 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HKDC1Q2TB90 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HKDC1Q2TB90 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HKDC1Q2TB90 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HKDC1Q2TB90 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HKDC1Q2TB90 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HKDC1Q2TB90 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HKDC1Q2TB90 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HKDC1Q2TB90 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HKDC1Q2TB90 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HKDC1Q2TB90 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HKDC1Q2TB90 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HKDC1Q2TB90 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HKDC1Q2TB90 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HKDC1Q2TB90 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HKDC1Q2TB90 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HKDC1Q2TB90 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HKDC1Q2TB90 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HKDC1Q2TB90 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HKDC1Q2TB90 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HKDC1Q2TB90 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HKDC1Q2TB90 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HKDC1Q2TB90 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HKDC1Q2TB90 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HKDC1Q2TB90 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HKDC1Q2TB90 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HKDC1Q2TB90 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HKDC1Q2TB90 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HKDC1Q2TB90 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HKDC1Q2TB90 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HKDC1Q2TB90 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HKDC1Q2TB90 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HKDC1Q2TB90 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HKDC1Q2TB90 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HKDC1Q2TB90 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HKDC1Q2TB90 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HKDC1Q2TB90 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HKDC1Q2TB90 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HKDC1Q2TB90 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HKDC1Q2TB90 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HKDC1Q2TB90 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HKDC1Q2TB90 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HKDC1Q2TB90 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HKDC1Q2TB90 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HKDC1Q2TB90 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HKDC1Q2TB90 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HKDC1Q2TB90 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
HKDC1Q2TB90 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HKDC1Q2TB90 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HKDC1Q2TB90 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HKDC1Q2TB90 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HKDC1Q2TB90 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HKDC1Q2TB90 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HKDC1Q2TB90 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HKDC1Q2TB90 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HKDC1Q2TB90 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HKDC1Q2TB90 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HKDC1Q2TB90 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms