Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC5A9Q2M3M2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC5A9Q2M3M2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC5A9Q2M3M2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC5A9Q2M3M2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC5A9Q2M3M2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC5A9Q2M3M2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC5A9Q2M3M2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC5A9Q2M3M2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC5A9Q2M3M2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC5A9Q2M3M2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC5A9Q2M3M2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC5A9Q2M3M2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC5A9Q2M3M2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC5A9Q2M3M2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC5A9Q2M3M2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC5A9Q2M3M2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC5A9Q2M3M2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC5A9Q2M3M2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC5A9Q2M3M2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC5A9Q2M3M2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC5A9Q2M3M2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC5A9Q2M3M2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC5A9Q2M3M2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC5A9Q2M3M2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC5A9Q2M3M2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC5A9Q2M3M2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC5A9Q2M3M2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC5A9Q2M3M2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC5A9Q2M3M2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC5A9Q2M3M2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC5A9Q2M3M2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLC5A9Q2M3M2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC5A9Q2M3M2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC5A9Q2M3M2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC5A9Q2M3M2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC5A9Q2M3M2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC5A9Q2M3M2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC5A9Q2M3M2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC5A9Q2M3M2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC5A9Q2M3M2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC5A9Q2M3M2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC5A9Q2M3M2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC5A9Q2M3M2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC5A9Q2M3M2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC5A9Q2M3M2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC5A9Q2M3M2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC5A9Q2M3M2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC5A9Q2M3M2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC5A9Q2M3M2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A9Q2M3M2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A9Q2M3M2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC5A9Q2M3M2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC5A9Q2M3M2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC5A9Q2M3M2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC5A9Q2M3M2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC5A9Q2M3M2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC5A9Q2M3M2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC5A9Q2M3M2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC5A9Q2M3M2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC5A9Q2M3M2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC5A9Q2M3M2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC5A9Q2M3M2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC5A9Q2M3M2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC5A9Q2M3M2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC5A9Q2M3M2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC5A9Q2M3M2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC5A9Q2M3M2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC5A9Q2M3M2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC5A9Q2M3M2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC5A9Q2M3M2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC5A9Q2M3M2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC5A9Q2M3M2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC5A9Q2M3M2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC5A9Q2M3M2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC5A9Q2M3M2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC5A9Q2M3M2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC5A9Q2M3M2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC5A9Q2M3M2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC5A9Q2M3M2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms