Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HADHQ16836 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HADHQ16836 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HADHQ16836 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HADHQ16836 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HADHQ16836 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HADHQ16836 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HADHQ16836 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HADHQ16836 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HADHQ16836 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HADHQ16836 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HADHQ16836 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HADHQ16836 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HADHQ16836 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HADHQ16836 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HADHQ16836 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HADHQ16836 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HADHQ16836 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HADHQ16836 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HADHQ16836 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HADHQ16836 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HADHQ16836 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HADHQ16836 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HADHQ16836 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HADHQ16836 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HADHQ16836 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HADHQ16836 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HADHQ16836 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HADHQ16836 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HADHQ16836 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HADHQ16836 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HADHQ16836 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HADHQ16836 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HADHQ16836 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HADHQ16836 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HADHQ16836 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HADHQ16836 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HADHQ16836 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HADHQ16836 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HADHQ16836 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HADHQ16836 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HADHQ16836 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HADHQ16836 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HADHQ16836 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HADHQ16836 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HADHQ16836 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HADHQ16836 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HADHQ16836 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HADHQ16836 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HADHQ16836 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HADHQ16836 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HADHQ16836 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HADHQ16836 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HADHQ16836 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HADHQ16836 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HADHQ16836 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HADHQ16836 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HADHQ16836 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HADHQ16836 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HADHQ16836 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HADHQ16836 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HADHQ16836 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HADHQ16836 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HADHQ16836 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HADHQ16836 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HADHQ16836 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HADHQ16836 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HADHQ16836 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HADHQ16836 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HADHQ16836 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HADHQ16836 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HADHQ16836 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HADHQ16836 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HADHQ16836 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HADHQ16836 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HADHQ16836 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HADHQ16836 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HADHQ16836 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HADHQ16836 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HADHQ16836 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HADHQ16836 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HADHQ16836 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HADHQ16836 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HADHQ16836 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HADHQ16836 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HADHQ16836 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HADHQ16836 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HADHQ16836 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HADHQ16836 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HADHQ16836 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HADHQ16836 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HADHQ16836 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HADHQ16836 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HADHQ16836 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HADHQ16836 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HADHQ16836 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HADHQ16836 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HADHQ16836 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HADHQ16836 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HADHQ16836 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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