Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

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Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R3AQ16821 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R3AQ16821 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R3AQ16821 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R3AQ16821 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R3AQ16821 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R3AQ16821 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R3AQ16821 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R3AQ16821 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R3AQ16821 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP1R3AQ16821 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP1R3AQ16821 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP1R3AQ16821 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP1R3AQ16821 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP1R3AQ16821 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP1R3AQ16821 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP1R3AQ16821 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP1R3AQ16821 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP1R3AQ16821 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPP1R3AQ16821 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPP1R3AQ16821 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPP1R3AQ16821 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPP1R3AQ16821 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPP1R3AQ16821 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPP1R3AQ16821 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPP1R3AQ16821 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPP1R3AQ16821 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPP1R3AQ16821 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PPP1R3AQ16821 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPP1R3AQ16821 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPP1R3AQ16821 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPP1R3AQ16821 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPP1R3AQ16821 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPP1R3AQ16821 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPP1R3AQ16821 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PPP1R3AQ16821 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PPP1R3AQ16821 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPP1R3AQ16821 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPP1R3AQ16821 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPP1R3AQ16821 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPP1R3AQ16821 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPP1R3AQ16821 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPP1R3AQ16821 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPP1R3AQ16821 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPP1R3AQ16821 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP1R3AQ16821 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PPP1R3AQ16821 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PPP1R3AQ16821 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP1R3AQ16821 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP1R3AQ16821 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP1R3AQ16821 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP1R3AQ16821 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPP1R3AQ16821 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPP1R3AQ16821 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPP1R3AQ16821 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPP1R3AQ16821 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R3AQ16821 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R3AQ16821 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPP1R3AQ16821 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPP1R3AQ16821 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R3AQ16821 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R3AQ16821 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R3AQ16821 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R3AQ16821 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R3AQ16821 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R3AQ16821 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R3AQ16821 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R3AQ16821 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R3AQ16821 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R3AQ16821 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1R3AQ16821 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1R3AQ16821 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1R3AQ16821 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1R3AQ16821 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP1R3AQ16821 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP1R3AQ16821 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP1R3AQ16821 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP1R3AQ16821 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPP1R3AQ16821 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPP1R3AQ16821 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPP1R3AQ16821 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPP1R3AQ16821 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPP1R3AQ16821 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPP1R3AQ16821 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PPP1R3AQ16821 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPP1R3AQ16821 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPP1R3AQ16821 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPP1R3AQ16821 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPP1R3AQ16821 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPP1R3AQ16821 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPP1R3AQ16821 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPP1R3AQ16821 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPP1R3AQ16821 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPP1R3AQ16821 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PPP1R3AQ16821 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPP1R3AQ16821 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPP1R3AQ16821 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPP1R3AQ16821 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPP1R3AQ16821 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPP1R3AQ16821 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
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