Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
STX1AQ16623 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
STX1AQ16623 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
STX1AQ16623 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
STX1AQ16623 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
STX1AQ16623 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
STX1AQ16623 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
STX1AQ16623 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
STX1AQ16623 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
STX1AQ16623 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
STX1AQ16623 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
STX1AQ16623 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
STX1AQ16623 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
STX1AQ16623 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
STX1AQ16623 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
STX1AQ16623 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
STX1AQ16623 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
STX1AQ16623 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
STX1AQ16623 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
STX1AQ16623 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
STX1AQ16623 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
STX1AQ16623 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
STX1AQ16623 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
STX1AQ16623 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
STX1AQ16623 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
STX1AQ16623 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
STX1AQ16623 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
STX1AQ16623 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
STX1AQ16623 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
STX1AQ16623 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
STX1AQ16623 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
STX1AQ16623 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
STX1AQ16623 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
STX1AQ16623 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
STX1AQ16623 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
STX1AQ16623 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
STX1AQ16623 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
STX1AQ16623 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
STX1AQ16623 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
STX1AQ16623 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
STX1AQ16623 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
STX1AQ16623 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
STX1AQ16623 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
STX1AQ16623 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
STX1AQ16623 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
STX1AQ16623 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
STX1AQ16623 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
STX1AQ16623 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
STX1AQ16623 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
STX1AQ16623 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
STX1AQ16623 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
STX1AQ16623 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
STX1AQ16623 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
STX1AQ16623 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
STX1AQ16623 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
STX1AQ16623 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
STX1AQ16623 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
STX1AQ16623 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
STX1AQ16623 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
STX1AQ16623 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
STX1AQ16623 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
STX1AQ16623 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
STX1AQ16623 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
STX1AQ16623 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
STX1AQ16623 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
STX1AQ16623 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
STX1AQ16623 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
STX1AQ16623 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
STX1AQ16623 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
STX1AQ16623 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
STX1AQ16623 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
STX1AQ16623 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
STX1AQ16623 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
STX1AQ16623 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
STX1AQ16623 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
STX1AQ16623 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
STX1AQ16623 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
STX1AQ16623 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
STX1AQ16623 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
STX1AQ16623 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
STX1AQ16623 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
STX1AQ16623 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
STX1AQ16623 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
STX1AQ16623 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
STX1AQ16623 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
STX1AQ16623 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
STX1AQ16623 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
STX1AQ16623 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
STX1AQ16623 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
STX1AQ16623 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
STX1AQ16623 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
STX1AQ16623 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
STX1AQ16623 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
STX1AQ16623 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
STX1AQ16623 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
STX1AQ16623 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
STX1AQ16623 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
STX1AQ16623 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
STX1AQ16623 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
STX1AQ16623 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
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