Protein–RNA interactions for Protein: Q16514

TAF12, Transcription initiation factor TFIID subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF12Q16514 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TAF12Q16514 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF12Q16514 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TAF12Q16514 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TAF12Q16514 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF12Q16514 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF12Q16514 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF12Q16514 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF12Q16514 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF12Q16514 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF12Q16514 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF12Q16514 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF12Q16514 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF12Q16514 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF12Q16514 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF12Q16514 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF12Q16514 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF12Q16514 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF12Q16514 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF12Q16514 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF12Q16514 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF12Q16514 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
TAF12Q16514 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF12Q16514 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF12Q16514 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TAF12Q16514 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAF12Q16514 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TAF12Q16514 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TAF12Q16514 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TAF12Q16514 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TAF12Q16514 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF12Q16514 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF12Q16514 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF12Q16514 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF12Q16514 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF12Q16514 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TAF12Q16514 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TAF12Q16514 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TAF12Q16514 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF12Q16514 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF12Q16514 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF12Q16514 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF12Q16514 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF12Q16514 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF12Q16514 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TAF12Q16514 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF12Q16514 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF12Q16514 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF12Q16514 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF12Q16514 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF12Q16514 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF12Q16514 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF12Q16514 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TAF12Q16514 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TAF12Q16514 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF12Q16514 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF12Q16514 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF12Q16514 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF12Q16514 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF12Q16514 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF12Q16514 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF12Q16514 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF12Q16514 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF12Q16514 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF12Q16514 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF12Q16514 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF12Q16514 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF12Q16514 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF12Q16514 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF12Q16514 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF12Q16514 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF12Q16514 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF12Q16514 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF12Q16514 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF12Q16514 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF12Q16514 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF12Q16514 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF12Q16514 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF12Q16514 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF12Q16514 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF12Q16514 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF12Q16514 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF12Q16514 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF12Q16514 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF12Q16514 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF12Q16514 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF12Q16514 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF12Q16514 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF12Q16514 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF12Q16514 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF12Q16514 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF12Q16514 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF12Q16514 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF12Q16514 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF12Q16514 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF12Q16514 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF12Q16514 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF12Q16514 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF12Q16514 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF12Q16514 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms