Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPTX1Q15818 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPTX1Q15818 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPTX1Q15818 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPTX1Q15818 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPTX1Q15818 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTX1Q15818 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTX1Q15818 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTX1Q15818 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTX1Q15818 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTX1Q15818 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTX1Q15818 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPTX1Q15818 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTX1Q15818 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTX1Q15818 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPTX1Q15818 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPTX1Q15818 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPTX1Q15818 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPTX1Q15818 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPTX1Q15818 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPTX1Q15818 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPTX1Q15818 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPTX1Q15818 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPTX1Q15818 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPTX1Q15818 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPTX1Q15818 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPTX1Q15818 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPTX1Q15818 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPTX1Q15818 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPTX1Q15818 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPTX1Q15818 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPTX1Q15818 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPTX1Q15818 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPTX1Q15818 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPTX1Q15818 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPTX1Q15818 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPTX1Q15818 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPTX1Q15818 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NPTX1Q15818 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPTX1Q15818 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPTX1Q15818 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPTX1Q15818 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPTX1Q15818 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPTX1Q15818 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPTX1Q15818 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPTX1Q15818 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NPTX1Q15818 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTX1Q15818 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTX1Q15818 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTX1Q15818 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTX1Q15818 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPTX1Q15818 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPTX1Q15818 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPTX1Q15818 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTX1Q15818 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTX1Q15818 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTX1Q15818 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPTX1Q15818 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPTX1Q15818 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPTX1Q15818 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPTX1Q15818 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTX1Q15818 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTX1Q15818 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPTX1Q15818 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPTX1Q15818 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPTX1Q15818 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPTX1Q15818 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPTX1Q15818 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPTX1Q15818 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPTX1Q15818 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPTX1Q15818 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPTX1Q15818 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPTX1Q15818 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPTX1Q15818 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPTX1Q15818 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPTX1Q15818 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPTX1Q15818 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPTX1Q15818 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPTX1Q15818 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPTX1Q15818 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPTX1Q15818 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPTX1Q15818 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPTX1Q15818 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPTX1Q15818 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPTX1Q15818 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPTX1Q15818 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPTX1Q15818 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPTX1Q15818 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPTX1Q15818 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPTX1Q15818 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPTX1Q15818 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPTX1Q15818 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPTX1Q15818 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPTX1Q15818 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPTX1Q15818 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPTX1Q15818 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPTX1Q15818 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPTX1Q15818 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPTX1Q15818 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPTX1Q15818 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms