Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NCOA1Q15788 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NCOA1Q15788 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NCOA1Q15788 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.21
NCOA1Q15788 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
NCOA1Q15788 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
NCOA1Q15788 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
NCOA1Q15788 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
NCOA1Q15788 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
NCOA1Q15788 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
NCOA1Q15788 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
NCOA1Q15788 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
NCOA1Q15788 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
NCOA1Q15788 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
NCOA1Q15788 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
NCOA1Q15788 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
NCOA1Q15788 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
NCOA1Q15788 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
NCOA1Q15788 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
NCOA1Q15788 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
NCOA1Q15788 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
NCOA1Q15788 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
NCOA1Q15788 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.1■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
NCOA1Q15788 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
NCOA1Q15788 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
NCOA1Q15788 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
NCOA1Q15788 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
NCOA1Q15788 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
NCOA1Q15788 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
NCOA1Q15788 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NCOA1Q15788 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NCOA1Q15788 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
NCOA1Q15788 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
NCOA1Q15788 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
NCOA1Q15788 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
NCOA1Q15788 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
NCOA1Q15788 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.89■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
NCOA1Q15788 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
NCOA1Q15788 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
NCOA1Q15788 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
NCOA1Q15788 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
NCOA1Q15788 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
NCOA1Q15788 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
NCOA1Q15788 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
NCOA1Q15788 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
NCOA1Q15788 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
NCOA1Q15788 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
NCOA1Q15788 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
NCOA1Q15788 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
NCOA1Q15788 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
NCOA1Q15788 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
NCOA1Q15788 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
NCOA1Q15788 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
NCOA1Q15788 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.67■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms