Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPEGQ15772 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPEGQ15772 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPEGQ15772 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPEGQ15772 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPEGQ15772 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPEGQ15772 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPEGQ15772 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPEGQ15772 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPEGQ15772 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPEGQ15772 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPEGQ15772 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPEGQ15772 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPEGQ15772 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPEGQ15772 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPEGQ15772 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPEGQ15772 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPEGQ15772 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPEGQ15772 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPEGQ15772 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPEGQ15772 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPEGQ15772 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPEGQ15772 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPEGQ15772 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPEGQ15772 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPEGQ15772 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SPEGQ15772 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPEGQ15772 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPEGQ15772 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPEGQ15772 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPEGQ15772 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPEGQ15772 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPEGQ15772 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPEGQ15772 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPEGQ15772 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPEGQ15772 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SPEGQ15772 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPEGQ15772 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPEGQ15772 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPEGQ15772 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPEGQ15772 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPEGQ15772 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPEGQ15772 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPEGQ15772 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPEGQ15772 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPEGQ15772 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPEGQ15772 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SPEGQ15772 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPEGQ15772 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPEGQ15772 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPEGQ15772 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPEGQ15772 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPEGQ15772 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPEGQ15772 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPEGQ15772 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPEGQ15772 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPEGQ15772 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPEGQ15772 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPEGQ15772 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPEGQ15772 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPEGQ15772 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPEGQ15772 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPEGQ15772 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPEGQ15772 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPEGQ15772 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SPEGQ15772 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SPEGQ15772 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPEGQ15772 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPEGQ15772 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPEGQ15772 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SPEGQ15772 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPEGQ15772 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPEGQ15772 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPEGQ15772 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SPEGQ15772 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPEGQ15772 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPEGQ15772 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPEGQ15772 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPEGQ15772 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPEGQ15772 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
SPEGQ15772 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPEGQ15772 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPEGQ15772 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPEGQ15772 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPEGQ15772 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPEGQ15772 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPEGQ15772 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPEGQ15772 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPEGQ15772 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SPEGQ15772 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPEGQ15772 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SPEGQ15772 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPEGQ15772 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPEGQ15772 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPEGQ15772 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPEGQ15772 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPEGQ15772 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPEGQ15772 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPEGQ15772 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPEGQ15772 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms