Protein–RNA interactions for Protein: Q15561

TEAD4, Transcriptional enhancer factor TEF-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEAD4Q15561 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TEAD4Q15561 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TEAD4Q15561 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TEAD4Q15561 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TEAD4Q15561 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TEAD4Q15561 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TEAD4Q15561 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TEAD4Q15561 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TEAD4Q15561 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TEAD4Q15561 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TEAD4Q15561 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TEAD4Q15561 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TEAD4Q15561 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TEAD4Q15561 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TEAD4Q15561 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TEAD4Q15561 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TEAD4Q15561 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TEAD4Q15561 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TEAD4Q15561 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TEAD4Q15561 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TEAD4Q15561 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TEAD4Q15561 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TEAD4Q15561 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TEAD4Q15561 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TEAD4Q15561 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TEAD4Q15561 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TEAD4Q15561 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TEAD4Q15561 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TEAD4Q15561 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TEAD4Q15561 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TEAD4Q15561 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TEAD4Q15561 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TEAD4Q15561 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TEAD4Q15561 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TEAD4Q15561 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TEAD4Q15561 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TEAD4Q15561 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TEAD4Q15561 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TEAD4Q15561 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TEAD4Q15561 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TEAD4Q15561 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TEAD4Q15561 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TEAD4Q15561 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TEAD4Q15561 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TEAD4Q15561 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TEAD4Q15561 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TEAD4Q15561 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TEAD4Q15561 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TEAD4Q15561 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TEAD4Q15561 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TEAD4Q15561 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TEAD4Q15561 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TEAD4Q15561 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TEAD4Q15561 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TEAD4Q15561 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TEAD4Q15561 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TEAD4Q15561 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TEAD4Q15561 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TEAD4Q15561 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TEAD4Q15561 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TEAD4Q15561 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TEAD4Q15561 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TEAD4Q15561 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TEAD4Q15561 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TEAD4Q15561 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TEAD4Q15561 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TEAD4Q15561 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TEAD4Q15561 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TEAD4Q15561 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TEAD4Q15561 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TEAD4Q15561 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TEAD4Q15561 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TEAD4Q15561 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TEAD4Q15561 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TEAD4Q15561 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TEAD4Q15561 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TEAD4Q15561 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TEAD4Q15561 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TEAD4Q15561 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TEAD4Q15561 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TEAD4Q15561 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TEAD4Q15561 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TEAD4Q15561 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TEAD4Q15561 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TEAD4Q15561 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TEAD4Q15561 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TEAD4Q15561 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TEAD4Q15561 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TEAD4Q15561 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TEAD4Q15561 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TEAD4Q15561 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TEAD4Q15561 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TEAD4Q15561 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TEAD4Q15561 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TEAD4Q15561 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TEAD4Q15561 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TEAD4Q15561 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TEAD4Q15561 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TEAD4Q15561 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TEAD4Q15561 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms