Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB35Q15286 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB35Q15286 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB35Q15286 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB35Q15286 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB35Q15286 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB35Q15286 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB35Q15286 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB35Q15286 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB35Q15286 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB35Q15286 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB35Q15286 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB35Q15286 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB35Q15286 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB35Q15286 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB35Q15286 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB35Q15286 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB35Q15286 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB35Q15286 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB35Q15286 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB35Q15286 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB35Q15286 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB35Q15286 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB35Q15286 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB35Q15286 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB35Q15286 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB35Q15286 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB35Q15286 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB35Q15286 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB35Q15286 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB35Q15286 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB35Q15286 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB35Q15286 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB35Q15286 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB35Q15286 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB35Q15286 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB35Q15286 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB35Q15286 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB35Q15286 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB35Q15286 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB35Q15286 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB35Q15286 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB35Q15286 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB35Q15286 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB35Q15286 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB35Q15286 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB35Q15286 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB35Q15286 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB35Q15286 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB35Q15286 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB35Q15286 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB35Q15286 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB35Q15286 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB35Q15286 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB35Q15286 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB35Q15286 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB35Q15286 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB35Q15286 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB35Q15286 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB35Q15286 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB35Q15286 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB35Q15286 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB35Q15286 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB35Q15286 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB35Q15286 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB35Q15286 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB35Q15286 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB35Q15286 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB35Q15286 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB35Q15286 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB35Q15286 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB35Q15286 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB35Q15286 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB35Q15286 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB35Q15286 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB35Q15286 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB35Q15286 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB35Q15286 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB35Q15286 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB35Q15286 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB35Q15286 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB35Q15286 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB35Q15286 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB35Q15286 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB35Q15286 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB35Q15286 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB35Q15286 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB35Q15286 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB35Q15286 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB35Q15286 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB35Q15286 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB35Q15286 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB35Q15286 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB35Q15286 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB35Q15286 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB35Q15286 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB35Q15286 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB35Q15286 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB35Q15286 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB35Q15286 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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