Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE1CQ14123 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE1CQ14123 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE1CQ14123 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE1CQ14123 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE1CQ14123 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE1CQ14123 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE1CQ14123 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDE1CQ14123 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDE1CQ14123 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE1CQ14123 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE1CQ14123 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE1CQ14123 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE1CQ14123 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE1CQ14123 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE1CQ14123 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE1CQ14123 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE1CQ14123 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE1CQ14123 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE1CQ14123 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE1CQ14123 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE1CQ14123 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE1CQ14123 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE1CQ14123 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE1CQ14123 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE1CQ14123 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE1CQ14123 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PDE1CQ14123 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE1CQ14123 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE1CQ14123 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE1CQ14123 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE1CQ14123 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PDE1CQ14123 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE1CQ14123 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE1CQ14123 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE1CQ14123 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE1CQ14123 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PDE1CQ14123 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE1CQ14123 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE1CQ14123 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE1CQ14123 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE1CQ14123 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE1CQ14123 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE1CQ14123 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE1CQ14123 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE1CQ14123 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE1CQ14123 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE1CQ14123 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE1CQ14123 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE1CQ14123 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE1CQ14123 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE1CQ14123 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE1CQ14123 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE1CQ14123 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE1CQ14123 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE1CQ14123 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE1CQ14123 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE1CQ14123 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE1CQ14123 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE1CQ14123 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE1CQ14123 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE1CQ14123 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE1CQ14123 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE1CQ14123 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE1CQ14123 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE1CQ14123 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE1CQ14123 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE1CQ14123 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE1CQ14123 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE1CQ14123 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE1CQ14123 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE1CQ14123 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE1CQ14123 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE1CQ14123 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE1CQ14123 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE1CQ14123 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE1CQ14123 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE1CQ14123 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE1CQ14123 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE1CQ14123 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE1CQ14123 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE1CQ14123 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE1CQ14123 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE1CQ14123 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE1CQ14123 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE1CQ14123 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE1CQ14123 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE1CQ14123 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE1CQ14123 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE1CQ14123 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE1CQ14123 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE1CQ14123 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE1CQ14123 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE1CQ14123 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE1CQ14123 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE1CQ14123 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE1CQ14123 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE1CQ14123 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE1CQ14123 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE1CQ14123 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
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