Protein–RNA interactions for Protein: Q14061

COX17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX17Q14061 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX17Q14061 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX17Q14061 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX17Q14061 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX17Q14061 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX17Q14061 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX17Q14061 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX17Q14061 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX17Q14061 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX17Q14061 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX17Q14061 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX17Q14061 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX17Q14061 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX17Q14061 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX17Q14061 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX17Q14061 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX17Q14061 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX17Q14061 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX17Q14061 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX17Q14061 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX17Q14061 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX17Q14061 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX17Q14061 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX17Q14061 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX17Q14061 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX17Q14061 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX17Q14061 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX17Q14061 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX17Q14061 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX17Q14061 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COX17Q14061 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX17Q14061 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX17Q14061 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX17Q14061 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX17Q14061 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COX17Q14061 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COX17Q14061 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COX17Q14061 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COX17Q14061 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COX17Q14061 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COX17Q14061 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COX17Q14061 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COX17Q14061 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COX17Q14061 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COX17Q14061 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COX17Q14061 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COX17Q14061 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COX17Q14061 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COX17Q14061 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX17Q14061 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX17Q14061 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX17Q14061 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX17Q14061 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX17Q14061 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COX17Q14061 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COX17Q14061 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX17Q14061 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX17Q14061 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX17Q14061 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COX17Q14061 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COX17Q14061 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COX17Q14061 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COX17Q14061 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COX17Q14061 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COX17Q14061 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COX17Q14061 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COX17Q14061 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COX17Q14061 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COX17Q14061 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COX17Q14061 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COX17Q14061 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COX17Q14061 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COX17Q14061 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COX17Q14061 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COX17Q14061 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COX17Q14061 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COX17Q14061 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COX17Q14061 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COX17Q14061 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COX17Q14061 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COX17Q14061 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COX17Q14061 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COX17Q14061 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COX17Q14061 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COX17Q14061 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COX17Q14061 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COX17Q14061 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COX17Q14061 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX17Q14061 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX17Q14061 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX17Q14061 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX17Q14061 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX17Q14061 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX17Q14061 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX17Q14061 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX17Q14061 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX17Q14061 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX17Q14061 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX17Q14061 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX17Q14061 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms