Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA9Q13797 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA9Q13797 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA9Q13797 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGA9Q13797 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGA9Q13797 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA9Q13797 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA9Q13797 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA9Q13797 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA9Q13797 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA9Q13797 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA9Q13797 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA9Q13797 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA9Q13797 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGA9Q13797 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA9Q13797 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA9Q13797 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA9Q13797 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA9Q13797 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA9Q13797 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA9Q13797 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA9Q13797 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA9Q13797 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA9Q13797 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA9Q13797 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA9Q13797 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA9Q13797 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA9Q13797 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA9Q13797 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA9Q13797 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA9Q13797 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA9Q13797 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA9Q13797 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA9Q13797 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA9Q13797 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA9Q13797 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA9Q13797 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA9Q13797 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA9Q13797 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA9Q13797 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA9Q13797 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA9Q13797 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA9Q13797 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA9Q13797 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA9Q13797 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA9Q13797 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA9Q13797 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA9Q13797 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGA9Q13797 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGA9Q13797 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA9Q13797 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA9Q13797 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA9Q13797 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA9Q13797 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA9Q13797 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA9Q13797 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA9Q13797 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA9Q13797 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA9Q13797 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA9Q13797 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA9Q13797 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA9Q13797 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA9Q13797 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ITGA9Q13797 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA9Q13797 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ITGA9Q13797 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA9Q13797 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA9Q13797 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA9Q13797 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA9Q13797 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA9Q13797 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA9Q13797 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA9Q13797 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA9Q13797 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA9Q13797 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA9Q13797 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA9Q13797 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA9Q13797 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA9Q13797 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGA9Q13797 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGA9Q13797 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGA9Q13797 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA9Q13797 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA9Q13797 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA9Q13797 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA9Q13797 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA9Q13797 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA9Q13797 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA9Q13797 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA9Q13797 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA9Q13797 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA9Q13797 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA9Q13797 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA9Q13797 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA9Q13797 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGA9Q13797 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA9Q13797 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA9Q13797 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA9Q13797 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGA9Q13797 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
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