Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTMR3Q13615 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MTMR3Q13615 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MTMR3Q13615 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
MTMR3Q13615 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MTMR3Q13615 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MTMR3Q13615 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MTMR3Q13615 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MTMR3Q13615 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MTMR3Q13615 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MTMR3Q13615 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MTMR3Q13615 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
MTMR3Q13615 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MTMR3Q13615 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MTMR3Q13615 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTMR3Q13615 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTMR3Q13615 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTMR3Q13615 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MTMR3Q13615 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MTMR3Q13615 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MTMR3Q13615 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MTMR3Q13615 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MTMR3Q13615 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MTMR3Q13615 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MTMR3Q13615 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MTMR3Q13615 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTMR3Q13615 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTMR3Q13615 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTMR3Q13615 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MTMR3Q13615 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTMR3Q13615 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTMR3Q13615 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTMR3Q13615 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTMR3Q13615 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MTMR3Q13615 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTMR3Q13615 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTMR3Q13615 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MTMR3Q13615 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MTMR3Q13615 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MTMR3Q13615 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MTMR3Q13615 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MTMR3Q13615 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MTMR3Q13615 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MTMR3Q13615 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MTMR3Q13615 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MTMR3Q13615 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
MTMR3Q13615 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MTMR3Q13615 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MTMR3Q13615 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MTMR3Q13615 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTMR3Q13615 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTMR3Q13615 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTMR3Q13615 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTMR3Q13615 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MTMR3Q13615 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTMR3Q13615 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTMR3Q13615 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTMR3Q13615 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTMR3Q13615 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MTMR3Q13615 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MTMR3Q13615 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MTMR3Q13615 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MTMR3Q13615 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MTMR3Q13615 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTMR3Q13615 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTMR3Q13615 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTMR3Q13615 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTMR3Q13615 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MTMR3Q13615 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTMR3Q13615 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTMR3Q13615 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTMR3Q13615 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTMR3Q13615 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MTMR3Q13615 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MTMR3Q13615 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTMR3Q13615 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTMR3Q13615 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTMR3Q13615 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTMR3Q13615 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MTMR3Q13615 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MTMR3Q13615 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MTMR3Q13615 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTMR3Q13615 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTMR3Q13615 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTMR3Q13615 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTMR3Q13615 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTMR3Q13615 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTMR3Q13615 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MTMR3Q13615 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTMR3Q13615 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTMR3Q13615 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTMR3Q13615 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MTMR3Q13615 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MTMR3Q13615 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MTMR3Q13615 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MTMR3Q13615 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTMR3Q13615 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTMR3Q13615 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTMR3Q13615 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTMR3Q13615 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
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