Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XRCC4Q13426 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
XRCC4Q13426 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
XRCC4Q13426 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XRCC4Q13426 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XRCC4Q13426 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XRCC4Q13426 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XRCC4Q13426 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XRCC4Q13426 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XRCC4Q13426 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XRCC4Q13426 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XRCC4Q13426 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XRCC4Q13426 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XRCC4Q13426 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XRCC4Q13426 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XRCC4Q13426 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XRCC4Q13426 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XRCC4Q13426 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XRCC4Q13426 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XRCC4Q13426 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XRCC4Q13426 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XRCC4Q13426 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XRCC4Q13426 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XRCC4Q13426 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XRCC4Q13426 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XRCC4Q13426 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XRCC4Q13426 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XRCC4Q13426 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XRCC4Q13426 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XRCC4Q13426 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XRCC4Q13426 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XRCC4Q13426 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XRCC4Q13426 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XRCC4Q13426 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XRCC4Q13426 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XRCC4Q13426 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
XRCC4Q13426 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
XRCC4Q13426 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
XRCC4Q13426 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
XRCC4Q13426 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
XRCC4Q13426 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XRCC4Q13426 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XRCC4Q13426 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XRCC4Q13426 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XRCC4Q13426 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XRCC4Q13426 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XRCC4Q13426 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XRCC4Q13426 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
XRCC4Q13426 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
XRCC4Q13426 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
XRCC4Q13426 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
XRCC4Q13426 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
XRCC4Q13426 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
XRCC4Q13426 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XRCC4Q13426 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XRCC4Q13426 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XRCC4Q13426 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
XRCC4Q13426 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XRCC4Q13426 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XRCC4Q13426 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XRCC4Q13426 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XRCC4Q13426 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XRCC4Q13426 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XRCC4Q13426 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XRCC4Q13426 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XRCC4Q13426 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
XRCC4Q13426 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
XRCC4Q13426 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
XRCC4Q13426 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XRCC4Q13426 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
XRCC4Q13426 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XRCC4Q13426 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XRCC4Q13426 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XRCC4Q13426 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XRCC4Q13426 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRCC4Q13426 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRCC4Q13426 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRCC4Q13426 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRCC4Q13426 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRCC4Q13426 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XRCC4Q13426 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
XRCC4Q13426 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XRCC4Q13426 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XRCC4Q13426 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XRCC4Q13426 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XRCC4Q13426 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XRCC4Q13426 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XRCC4Q13426 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XRCC4Q13426 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
XRCC4Q13426 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XRCC4Q13426 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XRCC4Q13426 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XRCC4Q13426 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XRCC4Q13426 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XRCC4Q13426 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XRCC4Q13426 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XRCC4Q13426 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XRCC4Q13426 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XRCC4Q13426 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XRCC4Q13426 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
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