Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDCLQ13371 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDCLQ13371 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PDCLQ13371 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDCLQ13371 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDCLQ13371 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDCLQ13371 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDCLQ13371 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDCLQ13371 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDCLQ13371 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDCLQ13371 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDCLQ13371 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDCLQ13371 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDCLQ13371 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDCLQ13371 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDCLQ13371 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDCLQ13371 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDCLQ13371 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDCLQ13371 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDCLQ13371 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PDCLQ13371 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDCLQ13371 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDCLQ13371 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PDCLQ13371 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDCLQ13371 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDCLQ13371 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCLQ13371 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCLQ13371 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCLQ13371 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDCLQ13371 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDCLQ13371 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDCLQ13371 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDCLQ13371 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PDCLQ13371 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDCLQ13371 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDCLQ13371 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDCLQ13371 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDCLQ13371 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDCLQ13371 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDCLQ13371 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDCLQ13371 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDCLQ13371 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDCLQ13371 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDCLQ13371 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDCLQ13371 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCLQ13371 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCLQ13371 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCLQ13371 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCLQ13371 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCLQ13371 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCLQ13371 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCLQ13371 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCLQ13371 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDCLQ13371 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCLQ13371 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCLQ13371 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCLQ13371 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCLQ13371 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCLQ13371 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCLQ13371 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCLQ13371 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDCLQ13371 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDCLQ13371 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDCLQ13371 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCLQ13371 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDCLQ13371 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDCLQ13371 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDCLQ13371 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDCLQ13371 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDCLQ13371 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDCLQ13371 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDCLQ13371 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDCLQ13371 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDCLQ13371 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDCLQ13371 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PDCLQ13371 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
PDCLQ13371 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCLQ13371 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCLQ13371 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCLQ13371 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCLQ13371 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCLQ13371 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCLQ13371 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDCLQ13371 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCLQ13371 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCLQ13371 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCLQ13371 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDCLQ13371 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDCLQ13371 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDCLQ13371 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDCLQ13371 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDCLQ13371 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDCLQ13371 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PDCLQ13371 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDCLQ13371 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDCLQ13371 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDCLQ13371 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCLQ13371 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCLQ13371 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCLQ13371 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms