Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK2Q13002 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK2Q13002 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK2Q13002 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK2Q13002 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK2Q13002 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK2Q13002 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK2Q13002 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK2Q13002 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK2Q13002 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GRIK2Q13002 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GRIK2Q13002 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIK2Q13002 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK2Q13002 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK2Q13002 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK2Q13002 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK2Q13002 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIK2Q13002 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIK2Q13002 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIK2Q13002 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIK2Q13002 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIK2Q13002 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK2Q13002 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK2Q13002 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK2Q13002 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK2Q13002 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK2Q13002 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK2Q13002 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK2Q13002 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK2Q13002 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIK2Q13002 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK2Q13002 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GRIK2Q13002 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIK2Q13002 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIK2Q13002 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIK2Q13002 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIK2Q13002 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIK2Q13002 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIK2Q13002 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIK2Q13002 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIK2Q13002 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIK2Q13002 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIK2Q13002 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIK2Q13002 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIK2Q13002 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIK2Q13002 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIK2Q13002 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIK2Q13002 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIK2Q13002 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIK2Q13002 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIK2Q13002 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIK2Q13002 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIK2Q13002 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIK2Q13002 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIK2Q13002 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIK2Q13002 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIK2Q13002 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIK2Q13002 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIK2Q13002 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIK2Q13002 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIK2Q13002 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIK2Q13002 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIK2Q13002 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIK2Q13002 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIK2Q13002 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIK2Q13002 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIK2Q13002 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIK2Q13002 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIK2Q13002 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIK2Q13002 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIK2Q13002 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIK2Q13002 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIK2Q13002 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIK2Q13002 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIK2Q13002 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIK2Q13002 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIK2Q13002 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIK2Q13002 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIK2Q13002 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIK2Q13002 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIK2Q13002 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIK2Q13002 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIK2Q13002 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIK2Q13002 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIK2Q13002 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIK2Q13002 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIK2Q13002 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIK2Q13002 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIK2Q13002 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIK2Q13002 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIK2Q13002 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIK2Q13002 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIK2Q13002 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIK2Q13002 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIK2Q13002 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIK2Q13002 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIK2Q13002 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIK2Q13002 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIK2Q13002 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GRIK2Q13002 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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