Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BNIP3Q12983 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BNIP3Q12983 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BNIP3Q12983 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BNIP3Q12983 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BNIP3Q12983 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BNIP3Q12983 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BNIP3Q12983 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BNIP3Q12983 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BNIP3Q12983 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BNIP3Q12983 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BNIP3Q12983 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BNIP3Q12983 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BNIP3Q12983 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BNIP3Q12983 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BNIP3Q12983 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BNIP3Q12983 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BNIP3Q12983 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BNIP3Q12983 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BNIP3Q12983 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BNIP3Q12983 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BNIP3Q12983 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BNIP3Q12983 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BNIP3Q12983 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BNIP3Q12983 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BNIP3Q12983 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
BNIP3Q12983 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BNIP3Q12983 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BNIP3Q12983 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BNIP3Q12983 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BNIP3Q12983 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BNIP3Q12983 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BNIP3Q12983 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BNIP3Q12983 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BNIP3Q12983 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BNIP3Q12983 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BNIP3Q12983 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BNIP3Q12983 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BNIP3Q12983 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BNIP3Q12983 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BNIP3Q12983 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BNIP3Q12983 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BNIP3Q12983 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BNIP3Q12983 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BNIP3Q12983 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BNIP3Q12983 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BNIP3Q12983 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BNIP3Q12983 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BNIP3Q12983 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BNIP3Q12983 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BNIP3Q12983 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BNIP3Q12983 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BNIP3Q12983 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BNIP3Q12983 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BNIP3Q12983 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BNIP3Q12983 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BNIP3Q12983 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BNIP3Q12983 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BNIP3Q12983 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BNIP3Q12983 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BNIP3Q12983 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BNIP3Q12983 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BNIP3Q12983 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BNIP3Q12983 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BNIP3Q12983 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BNIP3Q12983 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BNIP3Q12983 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BNIP3Q12983 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BNIP3Q12983 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BNIP3Q12983 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BNIP3Q12983 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BNIP3Q12983 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BNIP3Q12983 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BNIP3Q12983 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BNIP3Q12983 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BNIP3Q12983 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BNIP3Q12983 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BNIP3Q12983 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
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