Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAPQ12770 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAPQ12770 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAPQ12770 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAPQ12770 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCAPQ12770 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAPQ12770 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAPQ12770 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPQ12770 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPQ12770 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPQ12770 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAPQ12770 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms