Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAPQ12770 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAPQ12770 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAPQ12770 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAPQ12770 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAPQ12770 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAPQ12770 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCAPQ12770 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAPQ12770 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAPQ12770 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPQ12770 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPQ12770 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPQ12770 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAPQ12770 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPQ12770 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAPQ12770 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPQ12770 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAPQ12770 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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