Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCRN3Q0VDG4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCRN3Q0VDG4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCRN3Q0VDG4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCRN3Q0VDG4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCRN3Q0VDG4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCRN3Q0VDG4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCRN3Q0VDG4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCRN3Q0VDG4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCRN3Q0VDG4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCRN3Q0VDG4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCRN3Q0VDG4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCRN3Q0VDG4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCRN3Q0VDG4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCRN3Q0VDG4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCRN3Q0VDG4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SCRN3Q0VDG4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCRN3Q0VDG4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCRN3Q0VDG4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCRN3Q0VDG4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCRN3Q0VDG4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCRN3Q0VDG4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCRN3Q0VDG4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCRN3Q0VDG4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCRN3Q0VDG4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCRN3Q0VDG4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCRN3Q0VDG4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCRN3Q0VDG4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCRN3Q0VDG4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCRN3Q0VDG4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCRN3Q0VDG4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SCRN3Q0VDG4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCRN3Q0VDG4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCRN3Q0VDG4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCRN3Q0VDG4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCRN3Q0VDG4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCRN3Q0VDG4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCRN3Q0VDG4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCRN3Q0VDG4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCRN3Q0VDG4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCRN3Q0VDG4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCRN3Q0VDG4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCRN3Q0VDG4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCRN3Q0VDG4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCRN3Q0VDG4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCRN3Q0VDG4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCRN3Q0VDG4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCRN3Q0VDG4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCRN3Q0VDG4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCRN3Q0VDG4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCRN3Q0VDG4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCRN3Q0VDG4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCRN3Q0VDG4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCRN3Q0VDG4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCRN3Q0VDG4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCRN3Q0VDG4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCRN3Q0VDG4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCRN3Q0VDG4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCRN3Q0VDG4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCRN3Q0VDG4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCRN3Q0VDG4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCRN3Q0VDG4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCRN3Q0VDG4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCRN3Q0VDG4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCRN3Q0VDG4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCRN3Q0VDG4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCRN3Q0VDG4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCRN3Q0VDG4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCRN3Q0VDG4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCRN3Q0VDG4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCRN3Q0VDG4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCRN3Q0VDG4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCRN3Q0VDG4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCRN3Q0VDG4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCRN3Q0VDG4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCRN3Q0VDG4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCRN3Q0VDG4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCRN3Q0VDG4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCRN3Q0VDG4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCRN3Q0VDG4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCRN3Q0VDG4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCRN3Q0VDG4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCRN3Q0VDG4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCRN3Q0VDG4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCRN3Q0VDG4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCRN3Q0VDG4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCRN3Q0VDG4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCRN3Q0VDG4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCRN3Q0VDG4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCRN3Q0VDG4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCRN3Q0VDG4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCRN3Q0VDG4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCRN3Q0VDG4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCRN3Q0VDG4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCRN3Q0VDG4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCRN3Q0VDG4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCRN3Q0VDG4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCRN3Q0VDG4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCRN3Q0VDG4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCRN3Q0VDG4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms