Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CAMSAP2Q08AD1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CAMSAP2Q08AD1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CAMSAP2Q08AD1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CAMSAP2Q08AD1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CAMSAP2Q08AD1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CAMSAP2Q08AD1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CAMSAP2Q08AD1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CAMSAP2Q08AD1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
CAMSAP2Q08AD1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CAMSAP2Q08AD1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
CAMSAP2Q08AD1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
CAMSAP2Q08AD1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
CAMSAP2Q08AD1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
CAMSAP2Q08AD1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
CAMSAP2Q08AD1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CAMSAP2Q08AD1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
CAMSAP2Q08AD1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
CAMSAP2Q08AD1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
CAMSAP2Q08AD1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
CAMSAP2Q08AD1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
CAMSAP2Q08AD1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
CAMSAP2Q08AD1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CAMSAP2Q08AD1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
CAMSAP2Q08AD1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.58■■■■■ 4.25
CAMSAP2Q08AD1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.57■■■■■ 4.25
CAMSAP2Q08AD1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CAMSAP2Q08AD1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CAMSAP2Q08AD1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CAMSAP2Q08AD1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CAMSAP2Q08AD1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
CAMSAP2Q08AD1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
CAMSAP2Q08AD1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
CAMSAP2Q08AD1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CAMSAP2Q08AD1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CAMSAP2Q08AD1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CAMSAP2Q08AD1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
CAMSAP2Q08AD1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CAMSAP2Q08AD1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CAMSAP2Q08AD1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CAMSAP2Q08AD1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CAMSAP2Q08AD1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CAMSAP2Q08AD1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CAMSAP2Q08AD1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CAMSAP2Q08AD1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CAMSAP2Q08AD1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CAMSAP2Q08AD1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CAMSAP2Q08AD1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CAMSAP2Q08AD1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CAMSAP2Q08AD1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CAMSAP2Q08AD1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CAMSAP2Q08AD1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CAMSAP2Q08AD1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CAMSAP2Q08AD1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CAMSAP2Q08AD1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CAMSAP2Q08AD1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CAMSAP2Q08AD1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CAMSAP2Q08AD1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
CAMSAP2Q08AD1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CAMSAP2Q08AD1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CAMSAP2Q08AD1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CAMSAP2Q08AD1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CAMSAP2Q08AD1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CAMSAP2Q08AD1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CAMSAP2Q08AD1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CAMSAP2Q08AD1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CAMSAP2Q08AD1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CAMSAP2Q08AD1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CAMSAP2Q08AD1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CAMSAP2Q08AD1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CAMSAP2Q08AD1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CAMSAP2Q08AD1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CAMSAP2Q08AD1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CAMSAP2Q08AD1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CAMSAP2Q08AD1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
CAMSAP2Q08AD1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CAMSAP2Q08AD1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
CAMSAP2Q08AD1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CAMSAP2Q08AD1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CAMSAP2Q08AD1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CAMSAP2Q08AD1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CAMSAP2Q08AD1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CAMSAP2Q08AD1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CAMSAP2Q08AD1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CAMSAP2Q08AD1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CAMSAP2Q08AD1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
CAMSAP2Q08AD1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CAMSAP2Q08AD1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CAMSAP2Q08AD1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CAMSAP2Q08AD1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CAMSAP2Q08AD1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CAMSAP2Q08AD1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CAMSAP2Q08AD1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CAMSAP2Q08AD1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CAMSAP2Q08AD1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CAMSAP2Q08AD1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CAMSAP2Q08AD1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CAMSAP2Q08AD1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CAMSAP2Q08AD1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CAMSAP2Q08AD1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms