Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP1Q07954 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRP1Q07954 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP1Q07954 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP1Q07954 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP1Q07954 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRP1Q07954 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRP1Q07954 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRP1Q07954 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRP1Q07954 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRP1Q07954 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRP1Q07954 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRP1Q07954 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRP1Q07954 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRP1Q07954 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP1Q07954 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP1Q07954 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP1Q07954 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP1Q07954 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP1Q07954 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP1Q07954 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP1Q07954 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP1Q07954 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP1Q07954 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP1Q07954 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP1Q07954 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP1Q07954 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP1Q07954 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP1Q07954 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP1Q07954 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP1Q07954 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP1Q07954 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP1Q07954 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP1Q07954 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP1Q07954 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRP1Q07954 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRP1Q07954 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRP1Q07954 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRP1Q07954 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRP1Q07954 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRP1Q07954 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRP1Q07954 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRP1Q07954 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRP1Q07954 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRP1Q07954 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRP1Q07954 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LRP1Q07954 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRP1Q07954 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRP1Q07954 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRP1Q07954 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRP1Q07954 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRP1Q07954 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms