Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAX8Q06710 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAX8Q06710 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX8Q06710 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX8Q06710 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX8Q06710 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX8Q06710 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAX8Q06710 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAX8Q06710 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX8Q06710 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX8Q06710 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX8Q06710 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX8Q06710 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX8Q06710 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX8Q06710 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX8Q06710 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX8Q06710 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX8Q06710 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX8Q06710 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX8Q06710 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX8Q06710 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX8Q06710 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX8Q06710 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX8Q06710 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX8Q06710 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAX8Q06710 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAX8Q06710 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAX8Q06710 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAX8Q06710 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAX8Q06710 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PAX8Q06710 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAX8Q06710 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAX8Q06710 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAX8Q06710 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAX8Q06710 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAX8Q06710 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAX8Q06710 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAX8Q06710 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAX8Q06710 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAX8Q06710 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAX8Q06710 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAX8Q06710 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PAX8Q06710 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAX8Q06710 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAX8Q06710 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAX8Q06710 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAX8Q06710 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAX8Q06710 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAX8Q06710 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAX8Q06710 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAX8Q06710 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAX8Q06710 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAX8Q06710 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAX8Q06710 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAX8Q06710 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAX8Q06710 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX8Q06710 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX8Q06710 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX8Q06710 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX8Q06710 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX8Q06710 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAX8Q06710 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAX8Q06710 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAX8Q06710 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PAX8Q06710 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX8Q06710 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAX8Q06710 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAX8Q06710 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PAX8Q06710 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAX8Q06710 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAX8Q06710 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX8Q06710 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX8Q06710 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX8Q06710 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX8Q06710 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX8Q06710 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX8Q06710 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX8Q06710 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms