Protein–RNA interactions for Protein: Q06210

GFPT1, Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFPT1Q06210 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GFPT1Q06210 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GFPT1Q06210 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GFPT1Q06210 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GFPT1Q06210 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GFPT1Q06210 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GFPT1Q06210 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GFPT1Q06210 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GFPT1Q06210 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GFPT1Q06210 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GFPT1Q06210 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GFPT1Q06210 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GFPT1Q06210 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GFPT1Q06210 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GFPT1Q06210 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GFPT1Q06210 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GFPT1Q06210 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GFPT1Q06210 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GFPT1Q06210 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GFPT1Q06210 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GFPT1Q06210 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GFPT1Q06210 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GFPT1Q06210 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GFPT1Q06210 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GFPT1Q06210 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GFPT1Q06210 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GFPT1Q06210 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GFPT1Q06210 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GFPT1Q06210 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GFPT1Q06210 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GFPT1Q06210 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GFPT1Q06210 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GFPT1Q06210 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GFPT1Q06210 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GFPT1Q06210 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GFPT1Q06210 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GFPT1Q06210 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GFPT1Q06210 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GFPT1Q06210 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GFPT1Q06210 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GFPT1Q06210 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GFPT1Q06210 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GFPT1Q06210 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GFPT1Q06210 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GFPT1Q06210 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GFPT1Q06210 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GFPT1Q06210 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GFPT1Q06210 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GFPT1Q06210 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GFPT1Q06210 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GFPT1Q06210 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GFPT1Q06210 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GFPT1Q06210 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GFPT1Q06210 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GFPT1Q06210 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GFPT1Q06210 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GFPT1Q06210 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GFPT1Q06210 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GFPT1Q06210 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GFPT1Q06210 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GFPT1Q06210 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GFPT1Q06210 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GFPT1Q06210 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GFPT1Q06210 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GFPT1Q06210 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GFPT1Q06210 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GFPT1Q06210 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GFPT1Q06210 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GFPT1Q06210 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GFPT1Q06210 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GFPT1Q06210 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GFPT1Q06210 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GFPT1Q06210 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GFPT1Q06210 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GFPT1Q06210 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GFPT1Q06210 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GFPT1Q06210 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GFPT1Q06210 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GFPT1Q06210 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GFPT1Q06210 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GFPT1Q06210 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GFPT1Q06210 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GFPT1Q06210 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GFPT1Q06210 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GFPT1Q06210 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GFPT1Q06210 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GFPT1Q06210 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GFPT1Q06210 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GFPT1Q06210 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GFPT1Q06210 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GFPT1Q06210 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GFPT1Q06210 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GFPT1Q06210 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GFPT1Q06210 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GFPT1Q06210 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GFPT1Q06210 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GFPT1Q06210 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GFPT1Q06210 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GFPT1Q06210 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GFPT1Q06210 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms