Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTK2Q05397 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTK2Q05397 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTK2Q05397 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTK2Q05397 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTK2Q05397 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTK2Q05397 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTK2Q05397 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTK2Q05397 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTK2Q05397 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTK2Q05397 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTK2Q05397 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTK2Q05397 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTK2Q05397 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTK2Q05397 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTK2Q05397 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTK2Q05397 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTK2Q05397 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTK2Q05397 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTK2Q05397 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PTK2Q05397 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTK2Q05397 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTK2Q05397 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTK2Q05397 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTK2Q05397 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTK2Q05397 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PTK2Q05397 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTK2Q05397 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTK2Q05397 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTK2Q05397 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTK2Q05397 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTK2Q05397 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTK2Q05397 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTK2Q05397 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTK2Q05397 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTK2Q05397 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTK2Q05397 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTK2Q05397 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTK2Q05397 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTK2Q05397 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTK2Q05397 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTK2Q05397 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTK2Q05397 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTK2Q05397 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTK2Q05397 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTK2Q05397 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTK2Q05397 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTK2Q05397 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTK2Q05397 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTK2Q05397 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PTK2Q05397 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTK2Q05397 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTK2Q05397 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTK2Q05397 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTK2Q05397 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PTK2Q05397 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTK2Q05397 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTK2Q05397 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTK2Q05397 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTK2Q05397 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK2Q05397 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK2Q05397 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK2Q05397 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTK2Q05397 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTK2Q05397 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTK2Q05397 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTK2Q05397 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTK2Q05397 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTK2Q05397 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTK2Q05397 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTK2Q05397 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTK2Q05397 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTK2Q05397 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTK2Q05397 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTK2Q05397 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTK2Q05397 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTK2Q05397 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTK2Q05397 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTK2Q05397 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PTK2Q05397 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PTK2Q05397 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTK2Q05397 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTK2Q05397 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTK2Q05397 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTK2Q05397 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTK2Q05397 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTK2Q05397 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTK2Q05397 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PTK2Q05397 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTK2Q05397 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTK2Q05397 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTK2Q05397 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTK2Q05397 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTK2Q05397 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTK2Q05397 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTK2Q05397 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTK2Q05397 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTK2Q05397 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTK2Q05397 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTK2Q05397 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms