Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPN12Q05209 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPN12Q05209 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTPN12Q05209 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTPN12Q05209 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTPN12Q05209 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPN12Q05209 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPN12Q05209 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTPN12Q05209 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PTPN12Q05209 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTPN12Q05209 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTPN12Q05209 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTPN12Q05209 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PTPN12Q05209 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPN12Q05209 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPN12Q05209 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPN12Q05209 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPN12Q05209 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPN12Q05209 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPN12Q05209 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPN12Q05209 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPN12Q05209 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPN12Q05209 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPN12Q05209 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPN12Q05209 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPN12Q05209 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPN12Q05209 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPN12Q05209 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPN12Q05209 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPN12Q05209 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPN12Q05209 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPN12Q05209 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPN12Q05209 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPN12Q05209 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPN12Q05209 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPN12Q05209 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPN12Q05209 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPN12Q05209 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPN12Q05209 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPN12Q05209 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPN12Q05209 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPN12Q05209 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPN12Q05209 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PTPN12Q05209 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPN12Q05209 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPN12Q05209 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPN12Q05209 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PTPN12Q05209 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPN12Q05209 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPN12Q05209 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPN12Q05209 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPN12Q05209 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPN12Q05209 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPN12Q05209 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPN12Q05209 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPN12Q05209 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPN12Q05209 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPN12Q05209 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPN12Q05209 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPN12Q05209 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPN12Q05209 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPN12Q05209 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPN12Q05209 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPN12Q05209 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPN12Q05209 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPN12Q05209 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPN12Q05209 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPN12Q05209 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPN12Q05209 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPN12Q05209 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPN12Q05209 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPN12Q05209 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPN12Q05209 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPN12Q05209 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPN12Q05209 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPN12Q05209 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPN12Q05209 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPN12Q05209 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPN12Q05209 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPN12Q05209 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPN12Q05209 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPN12Q05209 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPN12Q05209 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPN12Q05209 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPN12Q05209 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPN12Q05209 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPN12Q05209 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPN12Q05209 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPN12Q05209 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPN12Q05209 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPN12Q05209 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPN12Q05209 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPN12Q05209 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPN12Q05209 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPN12Q05209 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPN12Q05209 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPN12Q05209 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPN12Q05209 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPN12Q05209 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPN12Q05209 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms