Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLCB3Q01970 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLCB3Q01970 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLCB3Q01970 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PLCB3Q01970 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLCB3Q01970 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PLCB3Q01970 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLCB3Q01970 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLCB3Q01970 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PLCB3Q01970 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLCB3Q01970 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLCB3Q01970 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLCB3Q01970 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLCB3Q01970 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLCB3Q01970 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLCB3Q01970 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PLCB3Q01970 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLCB3Q01970 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLCB3Q01970 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLCB3Q01970 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLCB3Q01970 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLCB3Q01970 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PLCB3Q01970 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PLCB3Q01970 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PLCB3Q01970 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PLCB3Q01970 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PLCB3Q01970 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLCB3Q01970 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLCB3Q01970 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLCB3Q01970 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLCB3Q01970 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLCB3Q01970 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLCB3Q01970 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLCB3Q01970 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLCB3Q01970 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLCB3Q01970 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLCB3Q01970 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLCB3Q01970 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLCB3Q01970 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLCB3Q01970 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLCB3Q01970 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLCB3Q01970 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLCB3Q01970 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLCB3Q01970 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLCB3Q01970 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLCB3Q01970 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLCB3Q01970 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLCB3Q01970 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLCB3Q01970 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLCB3Q01970 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLCB3Q01970 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLCB3Q01970 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLCB3Q01970 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLCB3Q01970 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLCB3Q01970 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLCB3Q01970 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLCB3Q01970 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLCB3Q01970 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLCB3Q01970 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLCB3Q01970 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLCB3Q01970 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLCB3Q01970 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLCB3Q01970 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLCB3Q01970 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLCB3Q01970 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLCB3Q01970 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLCB3Q01970 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLCB3Q01970 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PLCB3Q01970 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLCB3Q01970 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLCB3Q01970 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLCB3Q01970 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLCB3Q01970 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLCB3Q01970 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PLCB3Q01970 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLCB3Q01970 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PLCB3Q01970 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLCB3Q01970 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLCB3Q01970 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLCB3Q01970 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLCB3Q01970 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLCB3Q01970 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLCB3Q01970 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLCB3Q01970 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLCB3Q01970 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLCB3Q01970 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLCB3Q01970 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLCB3Q01970 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLCB3Q01970 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLCB3Q01970 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLCB3Q01970 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLCB3Q01970 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLCB3Q01970 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLCB3Q01970 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLCB3Q01970 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLCB3Q01970 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLCB3Q01970 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLCB3Q01970 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLCB3Q01970 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLCB3Q01970 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms