Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
POU5F1Q01860 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POU5F1Q01860 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
POU5F1Q01860 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
POU5F1Q01860 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
POU5F1Q01860 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
POU5F1Q01860 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POU5F1Q01860 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
POU5F1Q01860 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POU5F1Q01860 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POU5F1Q01860 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
POU5F1Q01860 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POU5F1Q01860 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
POU5F1Q01860 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POU5F1Q01860 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POU5F1Q01860 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
POU5F1Q01860 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
POU5F1Q01860 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
POU5F1Q01860 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POU5F1Q01860 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POU5F1Q01860 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POU5F1Q01860 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POU5F1Q01860 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POU5F1Q01860 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POU5F1Q01860 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POU5F1Q01860 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
POU5F1Q01860 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POU5F1Q01860 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POU5F1Q01860 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POU5F1Q01860 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POU5F1Q01860 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POU5F1Q01860 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POU5F1Q01860 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POU5F1Q01860 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POU5F1Q01860 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POU5F1Q01860 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POU5F1Q01860 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POU5F1Q01860 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POU5F1Q01860 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
POU5F1Q01860 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POU5F1Q01860 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POU5F1Q01860 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POU5F1Q01860 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
POU5F1Q01860 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POU5F1Q01860 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POU5F1Q01860 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POU5F1Q01860 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POU5F1Q01860 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
POU5F1Q01860 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
POU5F1Q01860 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POU5F1Q01860 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POU5F1Q01860 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POU5F1Q01860 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POU5F1Q01860 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POU5F1Q01860 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POU5F1Q01860 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POU5F1Q01860 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POU5F1Q01860 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POU5F1Q01860 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POU5F1Q01860 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POU5F1Q01860 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POU5F1Q01860 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POU5F1Q01860 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POU5F1Q01860 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POU5F1Q01860 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
POU5F1Q01860 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POU5F1Q01860 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POU5F1Q01860 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POU5F1Q01860 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POU5F1Q01860 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
POU5F1Q01860 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POU5F1Q01860 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POU5F1Q01860 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POU5F1Q01860 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POU5F1Q01860 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POU5F1Q01860 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POU5F1Q01860 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
POU5F1Q01860 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POU5F1Q01860 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POU5F1Q01860 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POU5F1Q01860 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
POU5F1Q01860 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POU5F1Q01860 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POU5F1Q01860 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POU5F1Q01860 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
POU5F1Q01860 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POU5F1Q01860 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POU5F1Q01860 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POU5F1Q01860 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POU5F1Q01860 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POU5F1Q01860 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
POU5F1Q01860 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
POU5F1Q01860 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
POU5F1Q01860 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
POU5F1Q01860 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
POU5F1Q01860 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POU5F1Q01860 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POU5F1Q01860 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POU5F1Q01860 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POU5F1Q01860 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms