Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MC1RQ01726 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MC1RQ01726 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MC1RQ01726 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MC1RQ01726 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MC1RQ01726 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MC1RQ01726 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MC1RQ01726 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MC1RQ01726 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MC1RQ01726 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MC1RQ01726 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MC1RQ01726 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MC1RQ01726 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MC1RQ01726 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MC1RQ01726 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MC1RQ01726 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MC1RQ01726 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MC1RQ01726 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MC1RQ01726 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MC1RQ01726 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MC1RQ01726 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MC1RQ01726 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
MC1RQ01726 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MC1RQ01726 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MC1RQ01726 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MC1RQ01726 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MC1RQ01726 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MC1RQ01726 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MC1RQ01726 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MC1RQ01726 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MC1RQ01726 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MC1RQ01726 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MC1RQ01726 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MC1RQ01726 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MC1RQ01726 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MC1RQ01726 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MC1RQ01726 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MC1RQ01726 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MC1RQ01726 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MC1RQ01726 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MC1RQ01726 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MC1RQ01726 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MC1RQ01726 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MC1RQ01726 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MC1RQ01726 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MC1RQ01726 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MC1RQ01726 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MC1RQ01726 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MC1RQ01726 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MC1RQ01726 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MC1RQ01726 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MC1RQ01726 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MC1RQ01726 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MC1RQ01726 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MC1RQ01726 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MC1RQ01726 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MC1RQ01726 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MC1RQ01726 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MC1RQ01726 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MC1RQ01726 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MC1RQ01726 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MC1RQ01726 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MC1RQ01726 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MC1RQ01726 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MC1RQ01726 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MC1RQ01726 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MC1RQ01726 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MC1RQ01726 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MC1RQ01726 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MC1RQ01726 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MC1RQ01726 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MC1RQ01726 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MC1RQ01726 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MC1RQ01726 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MC1RQ01726 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MC1RQ01726 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MC1RQ01726 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MC1RQ01726 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MC1RQ01726 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MC1RQ01726 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MC1RQ01726 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms