Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TFAP4Q01664 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TFAP4Q01664 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TFAP4Q01664 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TFAP4Q01664 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TFAP4Q01664 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TFAP4Q01664 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TFAP4Q01664 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TFAP4Q01664 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TFAP4Q01664 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TFAP4Q01664 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TFAP4Q01664 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TFAP4Q01664 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TFAP4Q01664 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TFAP4Q01664 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TFAP4Q01664 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TFAP4Q01664 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TFAP4Q01664 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
TFAP4Q01664 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TFAP4Q01664 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TFAP4Q01664 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TFAP4Q01664 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TFAP4Q01664 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TFAP4Q01664 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TFAP4Q01664 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TFAP4Q01664 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TFAP4Q01664 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TFAP4Q01664 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
TFAP4Q01664 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TFAP4Q01664 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TFAP4Q01664 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TFAP4Q01664 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TFAP4Q01664 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TFAP4Q01664 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
TFAP4Q01664 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TFAP4Q01664 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
TFAP4Q01664 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TFAP4Q01664 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TFAP4Q01664 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TFAP4Q01664 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TFAP4Q01664 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TFAP4Q01664 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TFAP4Q01664 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TFAP4Q01664 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TFAP4Q01664 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TFAP4Q01664 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TFAP4Q01664 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
TFAP4Q01664 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TFAP4Q01664 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TFAP4Q01664 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TFAP4Q01664 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
TFAP4Q01664 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
TFAP4Q01664 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TFAP4Q01664 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TFAP4Q01664 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TFAP4Q01664 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TFAP4Q01664 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TFAP4Q01664 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TFAP4Q01664 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TFAP4Q01664 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TFAP4Q01664 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TFAP4Q01664 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TFAP4Q01664 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TFAP4Q01664 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TFAP4Q01664 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
TFAP4Q01664 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TFAP4Q01664 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TFAP4Q01664 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TFAP4Q01664 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TFAP4Q01664 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TFAP4Q01664 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TFAP4Q01664 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TFAP4Q01664 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TFAP4Q01664 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TFAP4Q01664 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TFAP4Q01664 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TFAP4Q01664 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TFAP4Q01664 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TFAP4Q01664 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TFAP4Q01664 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TFAP4Q01664 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TFAP4Q01664 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TFAP4Q01664 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TFAP4Q01664 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TFAP4Q01664 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TFAP4Q01664 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TFAP4Q01664 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TFAP4Q01664 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TFAP4Q01664 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TFAP4Q01664 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TFAP4Q01664 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TFAP4Q01664 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TFAP4Q01664 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TFAP4Q01664 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TFAP4Q01664 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TFAP4Q01664 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
TFAP4Q01664 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TFAP4Q01664 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TFAP4Q01664 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TFAP4Q01664 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms