Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF9Q00978 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF9Q00978 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRF9Q00978 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRF9Q00978 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF9Q00978 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF9Q00978 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IRF9Q00978 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF9Q00978 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRF9Q00978 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRF9Q00978 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRF9Q00978 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRF9Q00978 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRF9Q00978 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRF9Q00978 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRF9Q00978 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
IRF9Q00978 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IRF9Q00978 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRF9Q00978 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRF9Q00978 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRF9Q00978 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRF9Q00978 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRF9Q00978 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRF9Q00978 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRF9Q00978 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRF9Q00978 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRF9Q00978 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRF9Q00978 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRF9Q00978 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRF9Q00978 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IRF9Q00978 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRF9Q00978 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRF9Q00978 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRF9Q00978 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRF9Q00978 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRF9Q00978 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRF9Q00978 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRF9Q00978 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRF9Q00978 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
IRF9Q00978 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRF9Q00978 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IRF9Q00978 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IRF9Q00978 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IRF9Q00978 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRF9Q00978 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRF9Q00978 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRF9Q00978 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRF9Q00978 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IRF9Q00978 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IRF9Q00978 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
IRF9Q00978 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IRF9Q00978 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IRF9Q00978 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IRF9Q00978 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IRF9Q00978 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRF9Q00978 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRF9Q00978 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRF9Q00978 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRF9Q00978 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRF9Q00978 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRF9Q00978 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRF9Q00978 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRF9Q00978 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRF9Q00978 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRF9Q00978 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRF9Q00978 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRF9Q00978 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRF9Q00978 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRF9Q00978 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IRF9Q00978 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
IRF9Q00978 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRF9Q00978 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
IRF9Q00978 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRF9Q00978 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRF9Q00978 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRF9Q00978 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRF9Q00978 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRF9Q00978 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRF9Q00978 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRF9Q00978 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRF9Q00978 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRF9Q00978 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRF9Q00978 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRF9Q00978 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRF9Q00978 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRF9Q00978 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRF9Q00978 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRF9Q00978 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRF9Q00978 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRF9Q00978 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRF9Q00978 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRF9Q00978 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRF9Q00978 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRF9Q00978 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRF9Q00978 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRF9Q00978 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRF9Q00978 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRF9Q00978 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRF9Q00978 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRF9Q00978 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.6 ms