Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKL1Q00532 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKL1Q00532 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKL1Q00532 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDKL1Q00532 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDKL1Q00532 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDKL1Q00532 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDKL1Q00532 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDKL1Q00532 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDKL1Q00532 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDKL1Q00532 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDKL1Q00532 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDKL1Q00532 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDKL1Q00532 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDKL1Q00532 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CDKL1Q00532 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDKL1Q00532 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDKL1Q00532 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDKL1Q00532 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDKL1Q00532 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDKL1Q00532 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDKL1Q00532 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDKL1Q00532 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDKL1Q00532 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDKL1Q00532 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDKL1Q00532 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKL1Q00532 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKL1Q00532 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKL1Q00532 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKL1Q00532 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKL1Q00532 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDKL1Q00532 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDKL1Q00532 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKL1Q00532 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKL1Q00532 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKL1Q00532 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDKL1Q00532 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKL1Q00532 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKL1Q00532 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKL1Q00532 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKL1Q00532 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKL1Q00532 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKL1Q00532 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDKL1Q00532 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CDKL1Q00532 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDKL1Q00532 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDKL1Q00532 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDKL1Q00532 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDKL1Q00532 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDKL1Q00532 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDKL1Q00532 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDKL1Q00532 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKL1Q00532 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CDKL1Q00532 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDKL1Q00532 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDKL1Q00532 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKL1Q00532 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKL1Q00532 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKL1Q00532 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDKL1Q00532 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDKL1Q00532 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDKL1Q00532 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDKL1Q00532 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CDKL1Q00532 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKL1Q00532 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDKL1Q00532 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDKL1Q00532 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDKL1Q00532 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDKL1Q00532 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKL1Q00532 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKL1Q00532 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKL1Q00532 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKL1Q00532 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CDKL1Q00532 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDKL1Q00532 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDKL1Q00532 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDKL1Q00532 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDKL1Q00532 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDKL1Q00532 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDKL1Q00532 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKL1Q00532 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms