Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTD2P86397 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTD2P86397 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTD2P86397 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTD2P86397 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTD2P86397 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTD2P86397 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTD2P86397 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTD2P86397 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTD2P86397 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTD2P86397 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTD2P86397 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTD2P86397 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTD2P86397 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTD2P86397 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTD2P86397 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTD2P86397 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTD2P86397 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTD2P86397 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTD2P86397 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTD2P86397 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTD2P86397 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTD2P86397 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTD2P86397 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTD2P86397 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTD2P86397 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTD2P86397 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTD2P86397 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTD2P86397 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTD2P86397 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTD2P86397 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTD2P86397 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTD2P86397 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTD2P86397 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTD2P86397 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTD2P86397 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTD2P86397 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTD2P86397 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTD2P86397 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTD2P86397 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTD2P86397 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTD2P86397 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTD2P86397 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTD2P86397 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTD2P86397 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTD2P86397 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTD2P86397 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTD2P86397 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTD2P86397 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTD2P86397 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTD2P86397 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTD2P86397 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTD2P86397 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTD2P86397 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTD2P86397 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTD2P86397 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTD2P86397 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTD2P86397 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTD2P86397 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTD2P86397 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTD2P86397 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTD2P86397 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTD2P86397 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTD2P86397 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HTD2P86397 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTD2P86397 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTD2P86397 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTD2P86397 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HTD2P86397 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTD2P86397 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTD2P86397 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTD2P86397 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTD2P86397 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTD2P86397 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTD2P86397 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTD2P86397 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTD2P86397 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTD2P86397 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTD2P86397 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTD2P86397 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTD2P86397 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTD2P86397 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTD2P86397 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HTD2P86397 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HTD2P86397 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTD2P86397 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTD2P86397 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTD2P86397 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTD2P86397 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTD2P86397 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTD2P86397 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTD2P86397 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTD2P86397 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTD2P86397 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTD2P86397 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTD2P86397 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTD2P86397 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTD2P86397 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTD2P86397 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTD2P86397 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms