Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HPCAP84074 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HPCAP84074 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPCAP84074 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPCAP84074 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPCAP84074 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPCAP84074 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPCAP84074 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPCAP84074 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPCAP84074 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPCAP84074 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPCAP84074 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPCAP84074 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPCAP84074 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HPCAP84074 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HPCAP84074 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HPCAP84074 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPCAP84074 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPCAP84074 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPCAP84074 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPCAP84074 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPCAP84074 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPCAP84074 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPCAP84074 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPCAP84074 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPCAP84074 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPCAP84074 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPCAP84074 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HPCAP84074 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HPCAP84074 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPCAP84074 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPCAP84074 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPCAP84074 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HPCAP84074 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPCAP84074 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPCAP84074 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPCAP84074 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPCAP84074 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPCAP84074 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPCAP84074 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HPCAP84074 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HPCAP84074 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HPCAP84074 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPCAP84074 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPCAP84074 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPCAP84074 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPCAP84074 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPCAP84074 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPCAP84074 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPCAP84074 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPCAP84074 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPCAP84074 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPCAP84074 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HPCAP84074 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HPCAP84074 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPCAP84074 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPCAP84074 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPCAP84074 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPCAP84074 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAP84074 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAP84074 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAP84074 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAP84074 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPCAP84074 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPCAP84074 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HPCAP84074 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HPCAP84074 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPCAP84074 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPCAP84074 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPCAP84074 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPCAP84074 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPCAP84074 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPCAP84074 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPCAP84074 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPCAP84074 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPCAP84074 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPCAP84074 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPCAP84074 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPCAP84074 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPCAP84074 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPCAP84074 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPCAP84074 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPCAP84074 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPCAP84074 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPCAP84074 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPCAP84074 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPCAP84074 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPCAP84074 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPCAP84074 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPCAP84074 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPCAP84074 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPCAP84074 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPCAP84074 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPCAP84074 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPCAP84074 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPCAP84074 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPCAP84074 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPCAP84074 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPCAP84074 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPCAP84074 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms