Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRPNP63162 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNRPNP63162 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRPNP63162 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRPNP63162 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRPNP63162 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRPNP63162 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRPNP63162 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPNP63162 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPNP63162 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPNP63162 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPNP63162 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPNP63162 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPNP63162 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNRPNP63162 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNRPNP63162 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPNP63162 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPNP63162 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPNP63162 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRPNP63162 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNRPNP63162 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRPNP63162 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRPNP63162 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRPNP63162 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRPNP63162 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRPNP63162 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRPNP63162 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRPNP63162 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRPNP63162 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRPNP63162 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPNP63162 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPNP63162 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPNP63162 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRPNP63162 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNRPNP63162 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNRPNP63162 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNRPNP63162 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRPNP63162 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRPNP63162 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRPNP63162 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRPNP63162 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRPNP63162 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRPNP63162 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRPNP63162 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRPNP63162 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPNP63162 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPNP63162 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPNP63162 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRPNP63162 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRPNP63162 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRPNP63162 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRPNP63162 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRPNP63162 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPNP63162 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPNP63162 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPNP63162 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPNP63162 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRPNP63162 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRPNP63162 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRPNP63162 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRPNP63162 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRPNP63162 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPNP63162 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPNP63162 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPNP63162 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPNP63162 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPNP63162 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRPNP63162 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRPNP63162 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRPNP63162 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPNP63162 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPNP63162 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPNP63162 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPNP63162 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRPNP63162 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRPNP63162 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNRPNP63162 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNRPNP63162 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNRPNP63162 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNRPNP63162 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNRPNP63162 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms