Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB2AP61019 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB2AP61019 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB2AP61019 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB2AP61019 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB2AP61019 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB2AP61019 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB2AP61019 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB2AP61019 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB2AP61019 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB2AP61019 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB2AP61019 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB2AP61019 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB2AP61019 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB2AP61019 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB2AP61019 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB2AP61019 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB2AP61019 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB2AP61019 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB2AP61019 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB2AP61019 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB2AP61019 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB2AP61019 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB2AP61019 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB2AP61019 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB2AP61019 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB2AP61019 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB2AP61019 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB2AP61019 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB2AP61019 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB2AP61019 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB2AP61019 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB2AP61019 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB2AP61019 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB2AP61019 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB2AP61019 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB2AP61019 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB2AP61019 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB2AP61019 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB2AP61019 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB2AP61019 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB2AP61019 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB2AP61019 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB2AP61019 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB2AP61019 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB2AP61019 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB2AP61019 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB2AP61019 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB2AP61019 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB2AP61019 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB2AP61019 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB2AP61019 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB2AP61019 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB2AP61019 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB2AP61019 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB2AP61019 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB2AP61019 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB2AP61019 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB2AP61019 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB2AP61019 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB2AP61019 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB2AP61019 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB2AP61019 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB2AP61019 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB2AP61019 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB2AP61019 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB2AP61019 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB2AP61019 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB2AP61019 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB2AP61019 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB2AP61019 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB2AP61019 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB2AP61019 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB2AP61019 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB2AP61019 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB2AP61019 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB2AP61019 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB2AP61019 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB2AP61019 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms