Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMA6P60900 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMA6P60900 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMA6P60900 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMA6P60900 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMA6P60900 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMA6P60900 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMA6P60900 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMA6P60900 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMA6P60900 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMA6P60900 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMA6P60900 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMA6P60900 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMA6P60900 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMA6P60900 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMA6P60900 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMA6P60900 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMA6P60900 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA6P60900 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA6P60900 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMA6P60900 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMA6P60900 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMA6P60900 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMA6P60900 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMA6P60900 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMA6P60900 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMA6P60900 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMA6P60900 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMA6P60900 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMA6P60900 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA6P60900 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA6P60900 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA6P60900 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA6P60900 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMA6P60900 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMA6P60900 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMA6P60900 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMA6P60900 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMA6P60900 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMA6P60900 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMA6P60900 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMA6P60900 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMA6P60900 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMA6P60900 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMA6P60900 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMA6P60900 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMA6P60900 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMA6P60900 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMA6P60900 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMA6P60900 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA6P60900 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA6P60900 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA6P60900 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA6P60900 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMA6P60900 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMA6P60900 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMA6P60900 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMA6P60900 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMA6P60900 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMA6P60900 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMA6P60900 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA6P60900 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMA6P60900 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMA6P60900 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMA6P60900 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMA6P60900 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMA6P60900 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMA6P60900 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMA6P60900 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMA6P60900 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMA6P60900 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMA6P60900 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMA6P60900 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMA6P60900 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA6P60900 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA6P60900 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA6P60900 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA6P60900 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA6P60900 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA6P60900 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMA6P60900 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms