Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVPABLB-1P60509 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVPABLB-1P60509 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ERVPABLB-1P60509 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVPABLB-1P60509 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVPABLB-1P60509 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVPABLB-1P60509 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVPABLB-1P60509 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVPABLB-1P60509 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVPABLB-1P60509 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVPABLB-1P60509 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVPABLB-1P60509 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVPABLB-1P60509 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERVPABLB-1P60509 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERVPABLB-1P60509 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERVPABLB-1P60509 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVPABLB-1P60509 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVPABLB-1P60509 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVPABLB-1P60509 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVPABLB-1P60509 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVPABLB-1P60509 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVPABLB-1P60509 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVPABLB-1P60509 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVPABLB-1P60509 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVPABLB-1P60509 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVPABLB-1P60509 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVPABLB-1P60509 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVPABLB-1P60509 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVPABLB-1P60509 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVPABLB-1P60509 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVPABLB-1P60509 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVPABLB-1P60509 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVPABLB-1P60509 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVPABLB-1P60509 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVPABLB-1P60509 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVPABLB-1P60509 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVPABLB-1P60509 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVPABLB-1P60509 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVPABLB-1P60509 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVPABLB-1P60509 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVPABLB-1P60509 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVPABLB-1P60509 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVPABLB-1P60509 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVPABLB-1P60509 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVPABLB-1P60509 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVPABLB-1P60509 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVPABLB-1P60509 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVPABLB-1P60509 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVPABLB-1P60509 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVPABLB-1P60509 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVPABLB-1P60509 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVPABLB-1P60509 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVPABLB-1P60509 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVPABLB-1P60509 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVPABLB-1P60509 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVPABLB-1P60509 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVPABLB-1P60509 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVPABLB-1P60509 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVPABLB-1P60509 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVPABLB-1P60509 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVPABLB-1P60509 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVPABLB-1P60509 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVPABLB-1P60509 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVPABLB-1P60509 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVPABLB-1P60509 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVPABLB-1P60509 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVPABLB-1P60509 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVPABLB-1P60509 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVPABLB-1P60509 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVPABLB-1P60509 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVPABLB-1P60509 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERVPABLB-1P60509 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVPABLB-1P60509 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVPABLB-1P60509 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVPABLB-1P60509 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVPABLB-1P60509 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVPABLB-1P60509 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVPABLB-1P60509 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVPABLB-1P60509 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVPABLB-1P60509 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVPABLB-1P60509 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVPABLB-1P60509 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVPABLB-1P60509 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVPABLB-1P60509 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVPABLB-1P60509 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVPABLB-1P60509 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVPABLB-1P60509 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVPABLB-1P60509 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVPABLB-1P60509 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVPABLB-1P60509 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVPABLB-1P60509 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVPABLB-1P60509 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVPABLB-1P60509 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVPABLB-1P60509 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVPABLB-1P60509 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVPABLB-1P60509 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVPABLB-1P60509 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVPABLB-1P60509 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVPABLB-1P60509 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms