Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RAB15P59190 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB15P59190 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB15P59190 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB15P59190 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB15P59190 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB15P59190 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB15P59190 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB15P59190 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB15P59190 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB15P59190 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB15P59190 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB15P59190 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB15P59190 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB15P59190 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB15P59190 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB15P59190 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB15P59190 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB15P59190 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB15P59190 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB15P59190 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB15P59190 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB15P59190 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB15P59190 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB15P59190 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB15P59190 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB15P59190 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB15P59190 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB15P59190 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB15P59190 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB15P59190 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB15P59190 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB15P59190 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB15P59190 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB15P59190 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB15P59190 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB15P59190 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB15P59190 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB15P59190 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB15P59190 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB15P59190 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB15P59190 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB15P59190 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB15P59190 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB15P59190 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB15P59190 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB15P59190 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB15P59190 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB15P59190 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB15P59190 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB15P59190 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB15P59190 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB15P59190 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB15P59190 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB15P59190 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB15P59190 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB15P59190 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB15P59190 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB15P59190 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB15P59190 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB15P59190 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB15P59190 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB15P59190 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB15P59190 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB15P59190 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB15P59190 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB15P59190 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB15P59190 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB15P59190 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB15P59190 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB15P59190 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB15P59190 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB15P59190 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB15P59190 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB15P59190 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB15P59190 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB15P59190 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB15P59190 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB15P59190 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB15P59190 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB15P59190 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB15P59190 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB15P59190 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB15P59190 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB15P59190 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB15P59190 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB15P59190 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB15P59190 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB15P59190 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB15P59190 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB15P59190 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB15P59190 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB15P59190 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB15P59190 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB15P59190 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB15P59190 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB15P59190 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB15P59190 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB15P59190 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB15P59190 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms