Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOXL3P58215 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL3P58215 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL3P58215 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXL3P58215 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LOXL3P58215 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL3P58215 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL3P58215 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL3P58215 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL3P58215 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL3P58215 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOXL3P58215 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXL3P58215 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXL3P58215 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXL3P58215 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXL3P58215 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXL3P58215 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXL3P58215 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXL3P58215 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXL3P58215 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXL3P58215 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL3P58215 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL3P58215 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LOXL3P58215 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LOXL3P58215 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LOXL3P58215 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LOXL3P58215 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LOXL3P58215 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LOXL3P58215 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LOXL3P58215 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LOXL3P58215 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LOXL3P58215 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LOXL3P58215 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LOXL3P58215 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LOXL3P58215 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LOXL3P58215 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LOXL3P58215 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LOXL3P58215 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LOXL3P58215 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LOXL3P58215 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LOXL3P58215 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LOXL3P58215 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL3P58215 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL3P58215 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL3P58215 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL3P58215 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL3P58215 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LOXL3P58215 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LOXL3P58215 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LOXL3P58215 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LOXL3P58215 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LOXL3P58215 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LOXL3P58215 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LOXL3P58215 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LOXL3P58215 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LOXL3P58215 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LOXL3P58215 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LOXL3P58215 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LOXL3P58215 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.1 ms