Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN8P56748 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN8P56748 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN8P56748 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN8P56748 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN8P56748 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN8P56748 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN8P56748 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN8P56748 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN8P56748 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN8P56748 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN8P56748 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN8P56748 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN8P56748 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN8P56748 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN8P56748 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN8P56748 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN8P56748 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN8P56748 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN8P56748 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN8P56748 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN8P56748 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN8P56748 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN8P56748 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN8P56748 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN8P56748 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN8P56748 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN8P56748 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN8P56748 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN8P56748 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN8P56748 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN8P56748 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN8P56748 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN8P56748 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN8P56748 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN8P56748 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN8P56748 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLDN8P56748 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN8P56748 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN8P56748 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN8P56748 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN8P56748 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN8P56748 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN8P56748 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN8P56748 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN8P56748 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN8P56748 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN8P56748 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN8P56748 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN8P56748 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN8P56748 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN8P56748 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN8P56748 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN8P56748 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN8P56748 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN8P56748 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN8P56748 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN8P56748 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN8P56748 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN8P56748 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN8P56748 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN8P56748 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN8P56748 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN8P56748 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN8P56748 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN8P56748 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN8P56748 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN8P56748 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN8P56748 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN8P56748 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN8P56748 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN8P56748 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN8P56748 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CLDN8P56748 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN8P56748 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN8P56748 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN8P56748 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN8P56748 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN8P56748 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN8P56748 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms